53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0640 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0640  putative lipoprotein, may be involved in cell division  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0255277  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0516  putative lipoprotein  42.64 
 
 
195 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05786  hypothetical protein  42.05 
 
 
189 aa  151  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000155  DamX-related protein  42.05 
 
 
189 aa  147  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.678183  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06425  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000594  putative DamX-related protein  33.33 
 
 
103 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  28.21 
 
 
350 aa  58.9  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  37.18 
 
 
340 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  31.15 
 
 
336 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  34.62 
 
 
329 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  35.37 
 
 
338 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  34.62 
 
 
329 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  34.62 
 
 
329 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  37.97 
 
 
541 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  33.33 
 
 
349 aa  53.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  36.71 
 
 
540 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  34.62 
 
 
533 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  27.06 
 
 
323 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  27.06 
 
 
323 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  33.33 
 
 
426 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  21.89 
 
 
505 aa  48.5  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  32.1 
 
 
525 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  31.25 
 
 
491 aa  48.5  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  34.18 
 
 
534 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  30.77 
 
 
428 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  34.18 
 
 
533 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  28.21 
 
 
504 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  30.77 
 
 
425 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  30.77 
 
 
432 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  34.18 
 
 
529 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2280  Sporulation domain protein  27.88 
 
 
499 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  32.91 
 
 
526 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  31.65 
 
 
550 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  29.49 
 
 
425 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  29.49 
 
 
425 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  29.49 
 
 
425 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  29.49 
 
 
425 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  29.49 
 
 
425 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  37.8 
 
 
506 aa  44.7  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  28.21 
 
 
497 aa  44.7  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  32.05 
 
 
551 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  26.58 
 
 
521 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  32.05 
 
 
548 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0104  sporulation domain-containing protein  30.48 
 
 
507 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  38.78 
 
 
533 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0664  hypothetical protein  26.58 
 
 
491 aa  41.6  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.564671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4263  sporulation domain-containing protein  28.12 
 
 
483 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353854  normal  0.0664789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>