29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0664 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0664  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  1005    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.564671  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00508  DamX-related protein  23.35 
 
 		 503 aa  104  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.512931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  29.31 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  28.57 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  26.26 
 
 		 505 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  30.43 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  30.43 
 
 		 349 aa  52.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  30.23 
 
 		 338 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  27.96 
 
 		 340 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  28 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  28 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  28 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  28 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  28 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  27.5 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  26.88 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  26.88 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  26.88 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  26.88 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  26.88 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  30.12 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  30.12 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  30.12 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  26.83 
 
 		 525 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  29.07 
 
 		 336 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  27.78 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  27.84 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  27.84 
 
 		 432 aa  44.3  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  27.84 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>