221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12827 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12827  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  545  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.12444e-28  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5571  AAA ATPase  66.54 
 
 
271 aa  338  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800357  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0555  AAA ATPase  66.17 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0572  AAA ATPase  66.17 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1689  AAA ATPase  66.17 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2502  AAA ATPase  66.17 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2927  AAA ATPase  66.17 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600702  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5447  AAA ATPase  65.43 
 
 
271 aa  334  7.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739293  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4945  general secretion pathway protein-related protein  68.03 
 
 
271 aa  332  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1286  general secretion pathway protein-related protein  66.17 
 
 
271 aa  325  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.385442  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4519  general secretion pathway protein-related protein  66.17 
 
 
271 aa  325  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2048  general secretion pathway protein-related protein  66.17 
 
 
271 aa  325  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00486349  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3743  general secretion pathway protein-related protein  66.67 
 
 
301 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.122195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0311  AAA ATPase  34.1 
 
 
266 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0329  AAA ATPase  33.72 
 
 
266 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2001  AAA ATPase  33.83 
 
 
266 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.249052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2821  AAA ATPase  33.83 
 
 
266 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3192  AAA ATPase  33.83 
 
 
266 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0103518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1683  AAA ATPase  33.83 
 
 
266 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1711  AAA ATPase  33.83 
 
 
266 aa  158  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0024  AAA ATPase  32.21 
 
 
266 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1681  AAA ATPase  33.33 
 
 
266 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1106  AAA ATPase  30.65 
 
 
266 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.597508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1875  AAA ATPase  30.65 
 
 
266 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.871076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1329  AAA ATPase  30.65 
 
 
266 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0545  AAA ATPase  30.65 
 
 
266 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0382  AAA ATPase  30.65 
 
 
266 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  30.86 
 
 
266 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  34.9 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1286  AAA ATPase  30.15 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1009  AAA ATPase  30.15 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3236  AAA ATPase  30.15 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2258  AAA ATPase  30.15 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0533  AAA ATPase  30.15 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1829  AAA ATPase  28.41 
 
 
266 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.569708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  31.5 
 
 
267 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.59 
 
 
536 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  37.65 
 
 
274 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  31.85 
 
 
266 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  31.85 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  37.65 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.08 
 
 
536 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.18 
 
 
587 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.43 
 
 
538 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  32.33 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  32.2 
 
 
540 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  36.84 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  31.34 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  32.73 
 
 
427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  30.97 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  31.14 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  33.58 
 
 
554 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.07 
 
 
562 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.07 
 
 
562 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.07 
 
 
562 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.06 
 
 
562 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.12 
 
 
558 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  29.32 
 
 
422 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  27.61 
 
 
505 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.23 
 
 
541 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  31.2 
 
 
498 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  31.68 
 
 
519 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.47 
 
 
613 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.85 
 
 
559 aa  122  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  29.32 
 
 
385 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.29 
 
 
557 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  32.34 
 
 
541 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.29 
 
 
557 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.29 
 
 
557 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.29 
 
 
557 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  31.7 
 
 
563 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  32.47 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.94 
 
 
564 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  31.95 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.57 
 
 
532 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  31.58 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  31.58 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  31.58 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  31.06 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  32.83 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  31.06 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.77 
 
 
572 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  31.84 
 
 
310 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  31.46 
 
 
310 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.85 
 
 
562 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  31.34 
 
 
284 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.29 
 
 
557 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  31.7 
 
 
549 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  29.12 
 
 
563 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  30.48 
 
 
538 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2098  type II secretory pathway ATPase ExeA  31.17 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  29.21 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  33.21 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  31.34 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  30.98 
 
 
334 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  30.6 
 
 
309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  29.2 
 
 
302 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  32.03 
 
 
320 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  31.75 
 
 
395 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  33.09 
 
 
308 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>