209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2098 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2098  type II secretory pathway ATPase ExeA  100 
 
 
257 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0563  hypothetical protein  99.09 
 
 
163 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4945  general secretion pathway protein-related protein  42.54 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.66 
 
 
613 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  34.11 
 
 
505 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2048  general secretion pathway protein-related protein  42.54 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00486349  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1286  general secretion pathway protein-related protein  42.54 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.385442  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4519  general secretion pathway protein-related protein  42.54 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.31 
 
 
538 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.16 
 
 
587 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 
541 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.27 
 
 
572 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 
562 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 
562 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.75 
 
 
562 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5447  AAA ATPase  39.55 
 
 
271 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739293  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5571  AAA ATPase  40.3 
 
 
271 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800357  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0555  AAA ATPase  39.55 
 
 
271 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0572  AAA ATPase  39.55 
 
 
271 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1689  AAA ATPase  39.55 
 
 
271 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2502  AAA ATPase  39.55 
 
 
271 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2927  AAA ATPase  39.55 
 
 
271 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600702  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.13 
 
 
558 aa  105  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.11 
 
 
568 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  37.76 
 
 
554 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3743  general secretion pathway protein-related protein  43.75 
 
 
301 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.122195 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  37.04 
 
 
519 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.29 
 
 
577 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.84 
 
 
559 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.29 
 
 
580 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  35.71 
 
 
540 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.7 
 
 
589 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  40.32 
 
 
549 aa  102  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  32.42 
 
 
271 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  45.45 
 
 
395 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  33.16 
 
 
257 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.88 
 
 
557 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12827  hypothetical protein  37.78 
 
 
270 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.12444e-28  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  37.74 
 
 
274 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 
557 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 
557 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  40.3 
 
 
381 aa  99.4  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.36 
 
 
557 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 
557 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  35.62 
 
 
584 aa  99.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  37.24 
 
 
563 aa  99  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  35.71 
 
 
354 aa  99  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  40.28 
 
 
529 aa  98.6  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1329  AAA ATPase  41.35 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  40.91 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1875  AAA ATPase  41.35 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.871076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.17 
 
 
556 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0545  AAA ATPase  41.35 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  34.38 
 
 
831 aa  98.2  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1106  AAA ATPase  41.35 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.597508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0382  AAA ATPase  41.35 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  33.33 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  35.76 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1683  AAA ATPase  38.35 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  38.1 
 
 
308 aa  96.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  35.42 
 
 
541 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0311  AAA ATPase  37.59 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  34.72 
 
 
538 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  35.71 
 
 
385 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  37.75 
 
 
387 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3192  AAA ATPase  37.59 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0103518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0329  AAA ATPase  36.84 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2001  AAA ATPase  37.59 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.249052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2821  AAA ATPase  37.59 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  37.97 
 
 
395 aa  95.1  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1711  AAA ATPase  37.59 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.67 
 
 
536 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1681  AAA ATPase  36.84 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 
562 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2258  AAA ATPase  39.85 
 
 
266 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.37 
 
 
536 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  34.38 
 
 
390 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3236  AAA ATPase  39.85 
 
 
266 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1829  AAA ATPase  34.55 
 
 
266 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.569708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0533  AAA ATPase  39.85 
 
 
266 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1009  AAA ATPase  39.85 
 
 
266 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1286  AAA ATPase  39.85 
 
 
266 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  39.13 
 
 
267 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  35.85 
 
 
274 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  35.85 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  39.2 
 
 
563 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  33.77 
 
 
341 aa  92.8  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  33.11 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  33.11 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  34.72 
 
 
393 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  37.41 
 
 
563 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  37.16 
 
 
532 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  40.3 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  32.45 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  38.02 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  33.12 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  35.46 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  36.96 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  35.77 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  36.96 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>