230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3743 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3743  general secretion pathway protein-related protein  100 
 
 
301 aa  608  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.122195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2048  general secretion pathway protein-related protein  99.61 
 
 
271 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00486349  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1286  general secretion pathway protein-related protein  99.61 
 
 
271 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.385442  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4519  general secretion pathway protein-related protein  99.61 
 
 
271 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4945  general secretion pathway protein-related protein  98.03 
 
 
271 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5571  AAA ATPase  78.8 
 
 
271 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800357  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5447  AAA ATPase  77.6 
 
 
271 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739293  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0555  AAA ATPase  78.4 
 
 
271 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0572  AAA ATPase  78.4 
 
 
271 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1689  AAA ATPase  78.4 
 
 
271 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2502  AAA ATPase  78.4 
 
 
271 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2927  AAA ATPase  78.4 
 
 
271 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600702  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12827  hypothetical protein  66.67 
 
 
270 aa  318  9e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.12444e-28  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0382  AAA ATPase  32.51 
 
 
266 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1106  AAA ATPase  32.51 
 
 
266 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.597508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1329  AAA ATPase  32.51 
 
 
266 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0545  AAA ATPase  32.51 
 
 
266 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1875  AAA ATPase  32.51 
 
 
266 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.871076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0311  AAA ATPase  34.31 
 
 
266 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0329  AAA ATPase  33.89 
 
 
266 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0533  AAA ATPase  32.1 
 
 
266 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3236  AAA ATPase  32.1 
 
 
266 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1286  AAA ATPase  32.1 
 
 
266 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1009  AAA ATPase  32.1 
 
 
266 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2258  AAA ATPase  32.1 
 
 
266 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1829  AAA ATPase  29.92 
 
 
266 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.569708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2821  AAA ATPase  32.92 
 
 
266 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1683  AAA ATPase  32.92 
 
 
266 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3192  AAA ATPase  32.92 
 
 
266 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0103518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2001  AAA ATPase  32.92 
 
 
266 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.249052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1711  AAA ATPase  32.92 
 
 
266 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  35.74 
 
 
267 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1681  AAA ATPase  33.47 
 
 
266 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0024  AAA ATPase  32.51 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  34.27 
 
 
266 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  32.26 
 
 
266 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  34.27 
 
 
266 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  33.33 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  37.45 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  36.33 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  36.33 
 
 
274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  35.66 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  34.84 
 
 
388 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  33.6 
 
 
540 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  33.09 
 
 
422 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.61 
 
 
562 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  31.17 
 
 
498 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  31.73 
 
 
266 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.38 
 
 
587 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.8 
 
 
536 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  32.4 
 
 
271 aa  115  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.1 
 
 
395 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  31.33 
 
 
385 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.4 
 
 
536 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  30.88 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  34.15 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  31.73 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  30.53 
 
 
505 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  32.14 
 
 
519 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  34.14 
 
 
541 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  30.67 
 
 
427 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.2 
 
 
562 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.2 
 
 
562 aa  113  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.97 
 
 
532 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  28.63 
 
 
390 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.2 
 
 
562 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  32.81 
 
 
554 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.55 
 
 
558 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.2 
 
 
538 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.56 
 
 
613 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  29.01 
 
 
393 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  32.13 
 
 
831 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.2 
 
 
541 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.46 
 
 
559 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2098  type II secretory pathway ATPase ExeA  43.48 
 
 
257 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.65 
 
 
564 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  33.46 
 
 
302 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  33.19 
 
 
387 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  33.46 
 
 
302 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  33.46 
 
 
302 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  33.46 
 
 
302 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.28 
 
 
572 aa  106  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  32.8 
 
 
281 aa  106  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  30.89 
 
 
334 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  31.33 
 
 
368 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.64 
 
 
557 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.89 
 
 
557 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 
557 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 
557 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  34 
 
 
275 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  34.27 
 
 
308 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
562 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.95 
 
 
589 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  33.73 
 
 
308 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  32.8 
 
 
309 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  29.32 
 
 
584 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  32.28 
 
 
549 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  32.8 
 
 
310 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  32.68 
 
 
309 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  30 
 
 
563 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>