232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2048 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1286  general secretion pathway protein-related protein  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.385442  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4519  general secretion pathway protein-related protein  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2048  general secretion pathway protein-related protein  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00486349  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4945  general secretion pathway protein-related protein  98.15 
 
 		 271 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3743  general secretion pathway protein-related protein  99.61 
 
 		 301 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.122195 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5571  AAA ATPase  76.38 
 
 		 271 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5447  AAA ATPase  75.28 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0555  AAA ATPase  76.01 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0572  AAA ATPase  76.01 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1689  AAA ATPase  76.01 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2502  AAA ATPase  76.01 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2927  AAA ATPase  76.01 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600702  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12827  hypothetical protein  67.17 
 
 		 270 aa  338  8e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.12444e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0545  AAA ATPase  32.27 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1875  AAA ATPase  32.27 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.871076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1106  AAA ATPase  32.27 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.597508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1329  AAA ATPase  32.27 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0382  AAA ATPase  32.27 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0311  AAA ATPase  33.46 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1683  AAA ATPase  32.7 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0329  AAA ATPase  33.08 
 
 		 266 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3192  AAA ATPase  32.7 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0103518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2001  AAA ATPase  32.7 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.249052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0024  AAA ATPase  32.18 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2821  AAA ATPase  32.7 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1711  AAA ATPase  32.7 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1681  AAA ATPase  32.7 
 
 		 266 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1829  AAA ATPase  30.28 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.569708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1286  AAA ATPase  31.66 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1009  AAA ATPase  31.66 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3236  AAA ATPase  31.66 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2258  AAA ATPase  31.66 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0533  AAA ATPase  31.66 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  35.83 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  33.46 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  32.41 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  33.46 
 
 		 266 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  33.2 
 
 		 267 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  37.45 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  36.33 
 
 		 274 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  36.33 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  34.7 
 
 		 422 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  34.34 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 587 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  32.82 
 
 		 540 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  31.89 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  34.84 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.46 
 
 		 558 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.07 
 
 		 538 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 562 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  30.6 
 
 		 498 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 562 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  32.97 
 
 		 554 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 562 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.7 
 
 		 559 aa  122  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.7 
 
 		 541 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  33.58 
 
 		 541 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  30.34 
 
 		 385 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.61 
 
 		 562 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  31.7 
 
 		 271 aa  118  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  29.37 
 
 		 505 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.95 
 
 		 536 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.68 
 
 		 532 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  31.48 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.57 
 
 		 536 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  31.94 
 
 		 519 aa  116  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.12 
 
 		 613 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 557 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 557 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.87 
 
 		 557 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 557 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  32.96 
 
 		 281 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.1 
 
 		 572 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.1 
 
 		 395 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  31.87 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  34.15 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  32.97 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2098  type II secretory pathway ATPase ExeA  42.36 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  32.97 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  32.97 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  32.97 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  30.11 
 
 		 563 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  28.63 
 
 		 390 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  33.07 
 
 		 831 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  30.92 
 
 		 427 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  33.58 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  33.71 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.7 
 
 		 564 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 589 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  28.46 
 
 		 393 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.46 
 
 		 562 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  32.47 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  34.82 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  31.66 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  32.1 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.58 
 
 		 557 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  32.21 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  31.99 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  30.83 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  31.6 
 
 		 318 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>