222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_62437 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_62437  predicted protein  100 
 
 
380 aa  786    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.278061  normal  0.0851814 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05778  actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06500)  51.17 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00940  structural constituent of cytoskeleton, putative  43.42 
 
 
413 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.49 
 
 
1583 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.79 
 
 
1609 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.35 
 
 
1547 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.53 
 
 
1398 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.53 
 
 
664 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.26 
 
 
1598 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.82 
 
 
1214 aa  74.7  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.69 
 
 
1267 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  25.3 
 
 
1714 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.51 
 
 
1711 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.2 
 
 
1626 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  29.39 
 
 
1766 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.09 
 
 
1623 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.25 
 
 
1760 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  28.25 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  29.39 
 
 
1334 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.16 
 
 
1652 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  27.06 
 
 
1190 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.29 
 
 
1599 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  26.64 
 
 
564 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.63 
 
 
1607 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.21 
 
 
1454 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.03 
 
 
1236 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  26.24 
 
 
1176 aa  66.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.05 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  28.02 
 
 
1661 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.12 
 
 
1684 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.98 
 
 
716 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  28.51 
 
 
1177 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.38 
 
 
1163 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  25.13 
 
 
1424 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.4 
 
 
1221 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.07 
 
 
1617 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  27.64 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  23.51 
 
 
1357 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.02 
 
 
1190 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.8 
 
 
1364 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  28.79 
 
 
1344 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.59 
 
 
1193 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  27.35 
 
 
1552 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.94 
 
 
677 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  26.22 
 
 
1100 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.07 
 
 
1523 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.02 
 
 
1789 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.03 
 
 
1858 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.57 
 
 
696 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.05 
 
 
1262 aa  63.2  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.07 
 
 
1161 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  25.52 
 
 
335 aa  63.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.29 
 
 
740 aa  62.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.07 
 
 
1161 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  29.36 
 
 
790 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.66 
 
 
1363 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.49 
 
 
1190 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.38 
 
 
1807 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.82 
 
 
947 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.7 
 
 
1856 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.19 
 
 
1217 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.03 
 
 
833 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.89 
 
 
865 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  28.19 
 
 
840 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.2 
 
 
1188 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.89 
 
 
1004 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.58 
 
 
675 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.53 
 
 
1211 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  26.48 
 
 
1491 aa  59.7  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.79 
 
 
434 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  24.75 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  27.22 
 
 
1330 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.4 
 
 
630 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
1481 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  25.65 
 
 
1599 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  26.92 
 
 
540 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0547  WD-40 repeat protein  34.21 
 
 
477 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  28.63 
 
 
1247 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.74 
 
 
742 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.21 
 
 
682 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.77 
 
 
1557 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  24.55 
 
 
1209 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.48 
 
 
919 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 
1183 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.53 
 
 
1553 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.11 
 
 
1510 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  24.34 
 
 
617 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.01 
 
 
1229 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.96 
 
 
1196 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.42 
 
 
1240 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3100  cytochrome c class I  25.32 
 
 
429 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00535618  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.11 
 
 
1164 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  25.11 
 
 
1367 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.19 
 
 
1209 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  27.91 
 
 
652 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.44 
 
 
924 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  26.84 
 
 
461 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.42 
 
 
676 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.34 
 
 
792 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03240  conserved hypothetical protein  23.21 
 
 
440 aa  56.2  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.60705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>