More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3100 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3100  cytochrome c class I  100 
 
 		 429 aa  817    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00535618  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5293  cytochrome c class I  79.71 
 
 		 426 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2844  WD-40 repeat-containing protein  68.7 
 
 		 440 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3070  WD-40 repeat protein  68.22 
 
 		 438 aa  535  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2962  cytochrome c class I  67.89 
 
 		 448 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3194  cytochrome c class I  65.34 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2440  WD-40 repeat-containing protein  53.5 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00410064  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5500  cytochrome c class I  52.06 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0508  cytochrome c class I  42.13 
 
 		 404 aa  256  8e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.278983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0404  cytochrome c, class I  34.52 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.11 
 
 		 1557 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.32 
 
 		 1240 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  31.42 
 
 		 1364 aa  132  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.62 
 
 		 1163 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  34.09 
 
 		 1510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.66 
 
 		 1481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.71 
 
 		 930 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  34.75 
 
 		 696 aa  127  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  32.34 
 
 		 1523 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.15 
 
 		 1652 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  35.02 
 
 		 1553 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  27.44 
 
 		 464 aa  123  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  30.36 
 
 		 1363 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.16 
 
 		 947 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  31.23 
 
 		 1831 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 1221 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.69 
 
 		 1236 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.75 
 
 		 1656 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  32.3 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  31.6 
 
 		 1304 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  37.37 
 
 		 1217 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  25.53 
 
 		 728 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1789 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.78 
 
 		 1609 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.69 
 
 		 740 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  30.62 
 
 		 1229 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  32 
 
 		 1176 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  29.18 
 
 		 1196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.89 
 
 		 1623 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33 
 
 		 1547 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  31.06 
 
 		 344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.58 
 
 		 1684 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.18 
 
 		 1454 aa  113  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.96 
 
 		 1188 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  30 
 
 		 1416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  33 
 
 		 1807 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.51 
 
 		 1267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.94 
 
 		 1193 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  32.32 
 
 		 1552 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.67 
 
 		 1367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  26.03 
 
 		 657 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.21 
 
 		 1626 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  26.11 
 
 		 1161 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.03 
 
 		 1599 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.11 
 
 		 1161 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  28.97 
 
 		 1164 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  29.25 
 
 		 1190 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.29 
 
 		 630 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  25.32 
 
 		 1247 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.74 
 
 		 1711 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.47 
 
 		 1213 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  29.09 
 
 		 1330 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.76 
 
 		 1188 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.86 
 
 		 1583 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.72 
 
 		 677 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.62 
 
 		 1607 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.36 
 
 		 676 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31 
 
 		 1398 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  36.75 
 
 		 1766 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.61 
 
 		 1598 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  34.21 
 
 		 1183 aa  103  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.74 
 
 		 682 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.04 
 
 		 1242 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  32.86 
 
 		 511 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  30.32 
 
 		 1714 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  32.2 
 
 		 872 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1599 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.58 
 
 		 919 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  26.62 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  33.01 
 
 		 1214 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.96 
 
 		 1686 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.65 
 
 		 692 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  34.87 
 
 		 1100 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  27.01 
 
 		 1177 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.66 
 
 		 924 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.71 
 
 		 1004 aa  99.8  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  29 
 
 		 1661 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  28.43 
 
 		 774 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  31.71 
 
 		 1041 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.03 
 
 		 664 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.55 
 
 		 1072 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  27.21 
 
 		 316 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.14 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.55 
 
 		 1076 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.84 
 
 		 642 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.23 
 
 		 576 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  32.27 
 
 		 742 aa  97.1  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.89 
 
 		 1039 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  28.08 
 
 		 316 aa  96.3  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>