83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00940 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF00940  structural constituent of cytoskeleton, putative  100 
 
 
413 aa  841    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05778  actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06500)  49.62 
 
 
363 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62437  predicted protein  43.42 
 
 
380 aa  338  9.999999999999999e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.278061  normal  0.0851814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.23 
 
 
1652 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.77 
 
 
1163 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.27 
 
 
1766 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.57 
 
 
1552 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  23.64 
 
 
1858 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24 
 
 
1363 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.39 
 
 
757 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.57 
 
 
1221 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.6 
 
 
1583 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.38 
 
 
1711 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.41 
 
 
1609 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  24.54 
 
 
1190 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.29 
 
 
1357 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  21.93 
 
 
1661 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.96 
 
 
1684 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.94 
 
 
1656 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.42 
 
 
1607 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.13 
 
 
664 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.18 
 
 
1789 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.89 
 
 
1364 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  22.92 
 
 
1714 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  26.16 
 
 
335 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  22.45 
 
 
1831 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.19 
 
 
1190 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  25.7 
 
 
1553 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.51 
 
 
1599 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  22.11 
 
 
1211 aa  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.18 
 
 
1262 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.43 
 
 
1209 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1263  WD-40 repeat protein  24.15 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.05 
 
 
1901 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.43 
 
 
1547 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.99 
 
 
1398 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.15 
 
 
1510 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01385  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08930)  28.97 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.45 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.01 
 
 
1267 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  32.35 
 
 
1599 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  23.61 
 
 
1188 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.79 
 
 
1623 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08017  catabolite degradation protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02400)  28.07 
 
 
827 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0053965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.8 
 
 
1617 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.82 
 
 
1626 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.65 
 
 
1477 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.02 
 
 
740 aa  46.6  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10942  conserved hypothetical protein similar to Aip1 (Eurofung)  30.49 
 
 
607 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.578742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.94 
 
 
1481 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  20.31 
 
 
1424 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.63 
 
 
1760 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03240  conserved hypothetical protein  22.94 
 
 
440 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.60705  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  29.06 
 
 
1311 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.21 
 
 
1598 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  23.45 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  23.19 
 
 
574 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42443  predicted protein  28.05 
 
 
1095 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0730577  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56141  protein involved in cell-cycle regulation of histone transcription  24.06 
 
 
959 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0125544  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  24.79 
 
 
1100 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  21.28 
 
 
1348 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.91 
 
 
1823 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  24.2 
 
 
565 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  25.95 
 
 
618 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 
329 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  25.47 
 
 
1334 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  23.23 
 
 
1214 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  30.99 
 
 
1161 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  30.99 
 
 
1161 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  22.91 
 
 
1491 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  24.1 
 
 
1229 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  25.38 
 
 
1289 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  21.36 
 
 
1807 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  28.3 
 
 
329 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.33 
 
 
833 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  23.81 
 
 
1217 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  23.08 
 
 
434 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.67 
 
 
1076 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  22.89 
 
 
363 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.57 
 
 
1856 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  28.44 
 
 
551 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  20.09 
 
 
1373 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.39 
 
 
1193 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>