118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2309 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 403 aa  828    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  53.25 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.23 
 
 		 412 aa  360  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  43 
 
 		 396 aa  348  8e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.24 
 
 		 416 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.04 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.21 
 
 		 403 aa  327  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.77 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.95 
 
 		 397 aa  315  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.55 
 
 		 402 aa  310  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  41.31 
 
 		 410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.56 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.04 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.62 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.7 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.81 
 
 		 419 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.29 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.55 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.82 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.91 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.33 
 
 		 382 aa  89.7  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.41 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.3 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  27.76 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  23.58 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  24.55 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.28 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.33 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.47 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.97 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.29 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.99 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.14 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.22 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  24.71 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.04 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.9 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.23 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.22 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.96 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.8 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  25.08 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.13 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.08 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.22 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.63 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.32 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  25.72 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.72 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.34 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  24.87 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  24.93 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.87 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.89 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.35 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.45 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.48 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  22.61 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  25.21 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  26.87 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.04 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.06 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  22.7 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  23.58 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.02 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.82 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  24.1 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  25.87 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.74 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.08 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.35 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.99 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  24.53 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  24.53 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.64 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  23.12 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.53 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.53 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.53 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.11 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.01 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.22 
 
 		 367 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.01 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.88 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  22.58 
 
 		 944 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  23.91 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2861  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  22.99 
 
 		 620 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.26 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  25.56 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1928  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  22.51 
 
 		 660 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  26.96 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1904  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  22.51 
 
 		 660 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  23.6 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.94 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4714  hypothetical protein  22.95 
 
 		 732 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.823146 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  25.82 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  23.47 
 
 		 489 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  23.47 
 
 		 485 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>