124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2967 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  871    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  70.66 
 
 		 419 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  71.18 
 
 		 414 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  69.04 
 
 		 419 aa  570  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  54.25 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  54.25 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.48 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.8 
 
 		 413 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.56 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.59 
 
 		 413 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.59 
 
 		 413 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.59 
 
 		 413 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  40.62 
 
 		 414 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.33 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.11 
 
 		 413 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.87 
 
 		 413 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.78432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  34.62 
 
 		 413 aa  252  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.62 
 
 		 413 aa  252  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  34.62 
 
 		 413 aa  252  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.62 
 
 		 413 aa  252  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  38.78 
 
 		 634 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.72 
 
 		 425 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  41.23 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.79 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  39.23 
 
 		 407 aa  239  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.39 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.3 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  36.23 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.59 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.99 
 
 		 417 aa  226  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.29 
 
 		 410 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.63 
 
 		 427 aa  219  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.32 
 
 		 419 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.68 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.77 
 
 		 416 aa  213  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.38 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.08 
 
 		 408 aa  209  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.34 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.22 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.17 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  33.95 
 
 		 411 aa  202  8e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.94 
 
 		 406 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.42 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.69 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  35.58 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.64 
 
 		 395 aa  196  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.9 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.84 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.9 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.9 
 
 		 427 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.9 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.38 
 
 		 426 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.33 
 
 		 401 aa  193  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.64 
 
 		 426 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  34.06 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.86 
 
 		 420 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.9 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.07 
 
 		 401 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.29 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.07 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  34.02 
 
 		 470 aa  183  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  30.41 
 
 		 391 aa  182  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.92 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.83 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.27 
 
 		 412 aa  180  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  34.79 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.11 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  34.79 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  34.79 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  34.79 
 
 		 500 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  34.79 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  34.54 
 
 		 489 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  34.54 
 
 		 485 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.99 
 
 		 395 aa  166  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  31.79 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  31.99 
 
 		 944 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.92 
 
 		 419 aa  136  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.52 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.33 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  26.22 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.65 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  28.26 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  29.81 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.09 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  26.2 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.72 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  24.38 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  29.67 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.41 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.46 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  25.36 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.05 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.08 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.08 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.08 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.84 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  23.71 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.96 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.73 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  23.98 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>