132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2359 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  97.08 
 
 
426 aa  687    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
343 aa  701    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  95.63 
 
 
426 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
426 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  95.04 
 
 
426 aa  677    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  99.71 
 
 
426 aa  702    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  95.63 
 
 
426 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  85.88 
 
 
470 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  86.35 
 
 
483 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  86.35 
 
 
485 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  86.35 
 
 
483 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  86.35 
 
 
483 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  86.35 
 
 
500 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  86.35 
 
 
483 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  83.69 
 
 
427 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  85.76 
 
 
489 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  83.08 
 
 
427 aa  577  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  82.73 
 
 
420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  67.06 
 
 
411 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.87 
 
 
412 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  56.32 
 
 
408 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  59.46 
 
 
401 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  60.36 
 
 
401 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  59.46 
 
 
401 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  55.22 
 
 
406 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  57.61 
 
 
394 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  56.76 
 
 
944 aa  378  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  55.93 
 
 
395 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  54.79 
 
 
401 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  54.43 
 
 
395 aa  352  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  50.76 
 
 
391 aa  351  8e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  53.15 
 
 
398 aa  342  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.45 
 
 
389 aa  341  9e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  52.15 
 
 
389 aa  325  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.39 
 
 
403 aa  265  7e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.89 
 
 
392 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  38.1 
 
 
435 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.51 
 
 
418 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  36.11 
 
 
418 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.02 
 
 
408 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  39 
 
 
419 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.97 
 
 
414 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.08 
 
 
418 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.87 
 
 
419 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.66 
 
 
419 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  38.13 
 
 
407 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.83 
 
 
417 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.29 
 
 
425 aa  146  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  37.69 
 
 
411 aa  143  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.93 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.36 
 
 
408 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.44 
 
 
413 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.44 
 
 
413 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.87 
 
 
414 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  35.42 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.14 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.14 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.14 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  34.53 
 
 
414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.06 
 
 
418 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.37 
 
 
404 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  30.54 
 
 
413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.54 
 
 
413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  30.54 
 
 
413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.54 
 
 
413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.54 
 
 
413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.01 
 
 
410 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.83 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.54 
 
 
413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.45 
 
 
417 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  36.13 
 
 
416 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.66 
 
 
417 aa  122  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.12 
 
 
427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.73 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.9 
 
 
417 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.16 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  32.69 
 
 
634 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.91 
 
 
424 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.93 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.58 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.14 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  29.97 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.74 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.03 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.67 
 
 
417 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.98 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.12 
 
 
400 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  25.58 
 
 
382 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.8 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.03 
 
 
394 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.68 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  30.8 
 
 
392 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.56 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  30.63 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.1 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.36 
 
 
375 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  30.05 
 
 
386 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.73 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.93 
 
 
434 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.43 
 
 
395 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>