115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3476 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
382 aa  799    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  29.03 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  28.96 
 
 
386 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  28.07 
 
 
401 aa  149  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  30.68 
 
 
385 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.97 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  29.41 
 
 
376 aa  127  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.78 
 
 
375 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.76 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.04 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  27.12 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  27.61 
 
 
408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.1 
 
 
413 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.68 
 
 
438 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  25.74 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  28.31 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.43 
 
 
404 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  25.97 
 
 
382 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.92 
 
 
377 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.27 
 
 
383 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  26.74 
 
 
390 aa  103  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  26.54 
 
 
367 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.54 
 
 
400 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.54 
 
 
400 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.54 
 
 
367 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  26.54 
 
 
367 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.54 
 
 
400 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  23.38 
 
 
384 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.07 
 
 
376 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  26.27 
 
 
403 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.18 
 
 
365 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  25.97 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.79 
 
 
377 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  25.5 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.14 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  25.54 
 
 
410 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.53 
 
 
395 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.53 
 
 
395 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.33 
 
 
403 aa  89.7  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.11 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.82 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  24.59 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.23 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.4 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.81 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.55 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.45 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.46 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.91 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.65 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.55 
 
 
419 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.78 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  25.09 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.22 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.42 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.35 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.38 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.68 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.91 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  25.09 
 
 
435 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.85 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.51 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.12 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.72 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.84 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.62 
 
 
426 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.88 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.37 
 
 
426 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.47 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.56 
 
 
426 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.56 
 
 
426 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.44 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  25.43 
 
 
427 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.56 
 
 
343 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.34 
 
 
427 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.29 
 
 
419 aa  56.6  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.65 
 
 
427 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  22.93 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.22 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.2 
 
 
394 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.32 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.76 
 
 
408 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  26.21 
 
 
470 aa  53.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  24.07 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  24.11 
 
 
944 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  24.66 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.33 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.17 
 
 
395 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.11 
 
 
419 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.7 
 
 
406 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.74 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  18.46 
 
 
402 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.16 
 
 
426 aa  50.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  24.11 
 
 
485 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  24.11 
 
 
500 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  24.11 
 
 
489 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.85 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  24.11 
 
 
483 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  24.11 
 
 
483 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.2 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>