96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2177 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  91.71 
 
 
400 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  91.71 
 
 
400 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  100 
 
 
399 aa  799    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  93.97 
 
 
367 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  92.82 
 
 
403 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  94.52 
 
 
367 aa  696    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  93.97 
 
 
367 aa  695    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  91.71 
 
 
400 aa  728    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  75 
 
 
395 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  77.6 
 
 
369 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  75 
 
 
395 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  76.26 
 
 
394 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  75.98 
 
 
369 aa  524  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  73.42 
 
 
394 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  74.8 
 
 
369 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  64.05 
 
 
377 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  65.55 
 
 
369 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  64.25 
 
 
369 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  60.66 
 
 
365 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  61.61 
 
 
344 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  54.29 
 
 
408 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.53 
 
 
375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.15 
 
 
377 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.5 
 
 
365 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.69 
 
 
404 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.09 
 
 
376 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  47.12 
 
 
404 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.96 
 
 
366 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.37 
 
 
377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.57 
 
 
413 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.82 
 
 
438 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  40.95 
 
 
410 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  32.32 
 
 
401 aa  136  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  32.99 
 
 
384 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  28.65 
 
 
374 aa  103  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  29.66 
 
 
386 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.97 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  29.23 
 
 
376 aa  96.3  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  28.72 
 
 
392 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  27.54 
 
 
385 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  28.75 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  28.8 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  26.94 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  39.37 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.07 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.06 
 
 
434 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.51 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.04 
 
 
392 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.17 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  35 
 
 
418 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  35 
 
 
418 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  34.29 
 
 
435 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.57 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.2 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.2 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.2 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.67 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.7 
 
 
389 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.84 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.2 
 
 
426 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.21 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.83 
 
 
393 aa  53.5  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.79 
 
 
389 aa  53.5  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.41 
 
 
423 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  34 
 
 
419 aa  53.5  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.32 
 
 
343 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.35 
 
 
383 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.77 
 
 
425 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.68 
 
 
418 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  26.88 
 
 
470 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.83 
 
 
426 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  27.56 
 
 
427 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.69 
 
 
419 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.11 
 
 
414 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.6 
 
 
403 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.35 
 
 
400 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.7 
 
 
419 aa  49.7  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.96 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.5 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.86 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.08 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  26.04 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.05 
 
 
427 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.17 
 
 
401 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.17 
 
 
408 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.79 
 
 
420 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 
392 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.15 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.38 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.51 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.86 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.76 
 
 
427 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.7 
 
 
425 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.07 
 
 
416 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.91 
 
 
427 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>