114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1762 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
418 aa  835    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  59.61 
 
 
415 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.12 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.9 
 
 
417 aa  333  5e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.73 
 
 
404 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  46.93 
 
 
634 aa  327  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  48.56 
 
 
407 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.03 
 
 
425 aa  316  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.1 
 
 
425 aa  315  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  45.78 
 
 
411 aa  315  9.999999999999999e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.74 
 
 
416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  44.36 
 
 
414 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.06 
 
 
408 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.39 
 
 
391 aa  292  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.9 
 
 
413 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.39 
 
 
413 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.39 
 
 
413 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.9 
 
 
413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  37.65 
 
 
413 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.65 
 
 
413 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  37.65 
 
 
413 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.65 
 
 
413 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.59 
 
 
410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.41 
 
 
413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.41 
 
 
413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.41 
 
 
413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  43.72 
 
 
416 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.84 
 
 
424 aa  281  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.89 
 
 
414 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.6 
 
 
419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.56 
 
 
417 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.95 
 
 
417 aa  243  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.69 
 
 
417 aa  229  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  37.53 
 
 
435 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.53 
 
 
418 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.63 
 
 
419 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.18 
 
 
414 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.59 
 
 
419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.37 
 
 
418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  32.84 
 
 
418 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.13 
 
 
403 aa  166  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  37.25 
 
 
944 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  30.05 
 
 
391 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.07 
 
 
427 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  33.05 
 
 
427 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.69 
 
 
406 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.88 
 
 
408 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.79 
 
 
401 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.55 
 
 
395 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.46 
 
 
392 aa  152  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.17 
 
 
389 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.96 
 
 
426 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.24 
 
 
426 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.49 
 
 
420 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.68 
 
 
426 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.47 
 
 
398 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  33.06 
 
 
470 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.46 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.25 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.64 
 
 
426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.45 
 
 
426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  34.15 
 
 
483 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  34.15 
 
 
483 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  34.15 
 
 
483 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  34.15 
 
 
500 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  34.15 
 
 
483 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  34.15 
 
 
489 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  32.41 
 
 
401 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  34.15 
 
 
485 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  33.73 
 
 
389 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.06 
 
 
343 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.99 
 
 
395 aa  142  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.52 
 
 
401 aa  142  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.8 
 
 
412 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.2 
 
 
401 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.05 
 
 
408 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.46 
 
 
419 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.93 
 
 
411 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  31.3 
 
 
369 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.96 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.69 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  31.82 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  27.98 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  30.49 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.82 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.82 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.95 
 
 
367 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.82 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  31.82 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  25.28 
 
 
374 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  31.82 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.19 
 
 
404 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.94 
 
 
365 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  30.68 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.09 
 
 
394 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.97 
 
 
427 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.87 
 
 
395 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.87 
 
 
395 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.13 
 
 
413 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.78 
 
 
438 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>