122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1919 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
419 aa  832    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  69.88 
 
 
408 aa  529  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.01 
 
 
392 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.58 
 
 
403 aa  259  7e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.35 
 
 
394 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.27 
 
 
398 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.75 
 
 
408 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  40.11 
 
 
401 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.11 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.27 
 
 
401 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.08 
 
 
427 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.86 
 
 
401 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  37.91 
 
 
427 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.12 
 
 
412 aa  207  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.91 
 
 
395 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.25 
 
 
426 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.92 
 
 
411 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  33.87 
 
 
391 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.71 
 
 
426 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.23 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.27 
 
 
420 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.25 
 
 
426 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.25 
 
 
426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.71 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.69 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.78 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.54 
 
 
395 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  38.25 
 
 
470 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.72 
 
 
425 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.17 
 
 
389 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  38.5 
 
 
483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  38.5 
 
 
483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  38.5 
 
 
483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  38.5 
 
 
500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  38.5 
 
 
483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  38.25 
 
 
485 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  38.25 
 
 
489 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.53 
 
 
343 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  34.26 
 
 
389 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  40 
 
 
944 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  38.82 
 
 
407 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.63 
 
 
416 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  38.46 
 
 
415 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.24 
 
 
410 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.52 
 
 
413 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.67 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  30.75 
 
 
413 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.75 
 
 
413 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  30.75 
 
 
413 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.75 
 
 
413 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.01 
 
 
413 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.75 
 
 
413 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  32.2 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  34.28 
 
 
411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.49 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.49 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.49 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.34 
 
 
414 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.66 
 
 
427 aa  140  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.3 
 
 
418 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  38.98 
 
 
435 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.99 
 
 
417 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.67 
 
 
419 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.83 
 
 
424 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.62 
 
 
418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  37.54 
 
 
634 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.48 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 
414 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.73 
 
 
419 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.05 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.77 
 
 
404 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  34.82 
 
 
414 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.07 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.83 
 
 
417 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.41 
 
 
417 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  37.84 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.48 
 
 
417 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  29.89 
 
 
408 aa  86.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.99 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.57 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  28.49 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.01 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  34.09 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.41 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  26.48 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.93 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  30.13 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.54 
 
 
365 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.94 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.37 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  29.89 
 
 
344 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.52 
 
 
377 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  27.27 
 
 
404 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.43 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  27.46 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.63 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.63 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.88 
 
 
369 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  27.05 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>