120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0909 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 377 aa  773    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  82.85 
 
 		 344 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  73.77 
 
 		 369 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  72.68 
 
 		 369 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  70.14 
 
 		 365 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  64.03 
 
 		 367 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  64.03 
 
 		 403 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  64.05 
 
 		 399 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  64.03 
 
 		 400 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  64.03 
 
 		 400 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  64.31 
 
 		 367 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  64.03 
 
 		 367 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  64.03 
 
 		 400 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.86 
 
 		 369 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.86 
 
 		 395 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.86 
 
 		 395 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  62.7 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  62.4 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  61.89 
 
 		 369 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  62.12 
 
 		 369 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.81 
 
 		 375 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.49 
 
 		 404 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  52.46 
 
 		 408 aa  348  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  50.99 
 
 		 404 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.69 
 
 		 377 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.83 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.1 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.55 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.83 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.63 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.18 
 
 		 438 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  41.53 
 
 		 410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.92 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  30 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  27.76 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  25.75 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  27.99 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  28.87 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  27.2 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  25.41 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  28.02 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.03 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.17 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.39 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.77 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  24 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.02 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.21 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  26.15 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.64 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.19 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.53 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.94 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.38 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.62 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  35.16 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.63 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.94 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  26.53 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.64 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  36.36 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.87 
 
 		 398 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  26.36 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.08 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.37 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.11 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.5 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.89 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.32 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.73 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  26.67 
 
 		 944 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.75 
 
 		 425 aa  53.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.7 
 
 		 390 aa  53.1  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.48 
 
 		 413 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.82 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.71 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.11 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.62 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.62 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.62 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.48 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  26.7 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  32.76 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.76 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.71 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.76 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.06 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.76 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.76 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  32.76 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.97 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.1 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.18 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.54 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.18 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.45 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.28 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0295295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>