127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0271 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
402 aa  847    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.58 
 
 
397 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.45 
 
 
392 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.82 
 
 
396 aa  364  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.11 
 
 
412 aa  353  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.96 
 
 
403 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.55 
 
 
403 aa  310  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.3 
 
 
434 aa  300  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.69 
 
 
416 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.55 
 
 
402 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.09 
 
 
390 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  36.03 
 
 
410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.34 
 
 
389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.32 
 
 
393 aa  227  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.63 
 
 
419 aa  202  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.1 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.38 
 
 
423 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.13 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.64 
 
 
401 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.13 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  22.93 
 
 
944 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.91 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  22.42 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  25.06 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.65 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.83 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.42 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.11 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.93 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.25 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.23 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.5 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.36 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  22.73 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.25 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.66 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.35 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.96 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.44 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.76 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.92 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.6 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.05 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  22.49 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.95 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  21.45 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.67 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.15 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  21.39 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.58 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.22 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  19.66 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.08 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.14 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.84 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.54 
 
 
425 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.15 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.4 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.42 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  21.18 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.9 
 
 
425 aa  63.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.09 
 
 
426 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.12 
 
 
413 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  21.59 
 
 
485 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.96 
 
 
377 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.34 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  21.59 
 
 
489 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.34 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.64 
 
 
377 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  24.17 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  21.45 
 
 
483 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.28 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.95 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  21.45 
 
 
483 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  21.45 
 
 
483 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  21.45 
 
 
500 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  21.45 
 
 
483 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.3 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  22.97 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.97 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  22.97 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.97 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.97 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.63 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.63 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.63 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.67 
 
 
403 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.69 
 
 
413 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.1 
 
 
418 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  23.38 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  22.64 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.46 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  22.04 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.01 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.25 
 
 
392 aa  57.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  24.15 
 
 
367 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.15 
 
 
367 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  24.15 
 
 
367 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.08 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  22.22 
 
 
369 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>