139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0887 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
416 aa  866    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.65 
 
 
412 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.24 
 
 
403 aa  343  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.33 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.81 
 
 
392 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.71 
 
 
434 aa  325  8.000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.18 
 
 
396 aa  322  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.4 
 
 
397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.69 
 
 
402 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.85 
 
 
403 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.42 
 
 
390 aa  280  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.51 
 
 
393 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.74 
 
 
389 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  35.53 
 
 
410 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.22 
 
 
419 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.31 
 
 
423 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.6 
 
 
427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  25.7 
 
 
391 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.06 
 
 
401 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.06 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.46 
 
 
417 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.95 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.63 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  24.87 
 
 
427 aa  96.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.17 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  26.5 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 
426 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.76 
 
 
426 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.5 
 
 
427 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.24 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.4 
 
 
401 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  26.25 
 
 
944 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.69 
 
 
393 aa  90.5  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.76 
 
 
426 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.76 
 
 
426 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.09 
 
 
393 aa  89.7  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  24.45 
 
 
485 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  24.15 
 
 
470 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.25 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.74 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  24.21 
 
 
489 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.2 
 
 
420 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  24.21 
 
 
483 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  24.21 
 
 
483 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  24.21 
 
 
483 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  24.21 
 
 
483 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  24.21 
 
 
500 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.41 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  24.12 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.58 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.01 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  23.33 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.82 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.67 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.44 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.08 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.51 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.54 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  24.16 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2861  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  23.84 
 
 
620 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.7 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.78 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.35 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  23.19 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.63 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  26.35 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.35 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  26.35 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.35 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.3 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.32 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.66 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.5 
 
 
413 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.78 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.96 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.78 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.78 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.14 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.79 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4714  hypothetical protein  23.08 
 
 
732 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.823146 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.25 
 
 
412 aa  69.7  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.78 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1904  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  22.81 
 
 
660 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1928  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  22.81 
 
 
660 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.74 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.2 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0816  hypothetical protein  24.52 
 
 
719 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0362395  hitchhiker  0.000117327 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.52 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.75 
 
 
366 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  25.27 
 
 
634 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.08 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.52 
 
 
403 aa  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.77 
 
 
369 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  23.97 
 
 
392 aa  63.2  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  29.66 
 
 
369 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.85 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.22 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.49 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.14 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  21.67 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>