134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1942 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
416 aa  843    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  60.73 
 
 
413 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  60.39 
 
 
413 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  60.39 
 
 
413 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  60.39 
 
 
413 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  60.39 
 
 
413 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  60.88 
 
 
413 aa  537  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  61.12 
 
 
413 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  60.39 
 
 
413 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  60.39 
 
 
413 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  60.39 
 
 
413 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  60.88 
 
 
413 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  52.9 
 
 
634 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  56.6 
 
 
410 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.44 
 
 
424 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.61 
 
 
425 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.12 
 
 
425 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.14 
 
 
414 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  48.14 
 
 
414 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.88 
 
 
419 aa  359  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.65 
 
 
427 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  47.45 
 
 
415 aa  350  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  48.97 
 
 
407 aa  344  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  46.8 
 
 
416 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.03 
 
 
408 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.17 
 
 
417 aa  329  6e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  43.28 
 
 
411 aa  323  5e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.01 
 
 
404 aa  322  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.86 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.16 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.74 
 
 
418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.71 
 
 
417 aa  299  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.81 
 
 
391 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.29 
 
 
419 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  36.62 
 
 
435 aa  229  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.62 
 
 
418 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.07 
 
 
414 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  32.85 
 
 
418 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.48 
 
 
418 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.78 
 
 
419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.28 
 
 
403 aa  206  7e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.06 
 
 
401 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.97 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.95 
 
 
412 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.92 
 
 
392 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.49 
 
 
395 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.81 
 
 
401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.85 
 
 
426 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.75 
 
 
398 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.32 
 
 
419 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.38 
 
 
426 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.2 
 
 
408 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.34 
 
 
408 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.3 
 
 
426 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  32.98 
 
 
401 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.72 
 
 
401 aa  159  7e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  29.44 
 
 
391 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  32.75 
 
 
470 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.11 
 
 
426 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.11 
 
 
426 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.23 
 
 
427 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  32.04 
 
 
427 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.33 
 
 
389 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  33.24 
 
 
944 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.59 
 
 
426 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.41 
 
 
420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.53 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.48 
 
 
394 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.59 
 
 
395 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  32.64 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  32.64 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.83 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.64 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  32.64 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.64 
 
 
489 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.64 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.64 
 
 
500 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  29.87 
 
 
389 aa  135  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.42 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.33 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.63 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.18 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.48 
 
 
392 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  25.56 
 
 
385 aa  61.6  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  26.32 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.52 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.87 
 
 
366 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  28.17 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.43 
 
 
365 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.88 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.22 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.64 
 
 
375 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.04 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.04 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.35 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.92 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.92 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.92 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.19 
 
 
400 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.91 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>