95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0790 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
417 aa  832    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  50.48 
 
 
414 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.32 
 
 
414 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.97 
 
 
419 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.99 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.3 
 
 
413 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.3 
 
 
413 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.56 
 
 
413 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.32 
 
 
413 aa  342  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.07 
 
 
413 aa  342  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.07 
 
 
413 aa  342  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  43.07 
 
 
413 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  43.07 
 
 
413 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.06 
 
 
413 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.06 
 
 
413 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.06 
 
 
413 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  49.01 
 
 
416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.26 
 
 
417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.97 
 
 
417 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.92 
 
 
416 aa  316  6e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.85 
 
 
410 aa  295  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.67 
 
 
427 aa  293  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.83 
 
 
425 aa  293  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  42.79 
 
 
415 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  44.73 
 
 
407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  42.79 
 
 
634 aa  279  5e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.1 
 
 
404 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.85 
 
 
425 aa  276  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.8 
 
 
417 aa  276  7e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  39.76 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.03 
 
 
391 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.22 
 
 
424 aa  239  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.17 
 
 
418 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.8 
 
 
418 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  39.55 
 
 
435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  35.12 
 
 
418 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.89 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.47 
 
 
419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.5 
 
 
414 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.77 
 
 
419 aa  206  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.75 
 
 
403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.72 
 
 
398 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.21 
 
 
412 aa  143  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  30.43 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.25 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.03 
 
 
394 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  28.89 
 
 
391 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.49 
 
 
401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.71 
 
 
426 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.16 
 
 
427 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.49 
 
 
408 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.13 
 
 
426 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.98 
 
 
426 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.98 
 
 
426 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.13 
 
 
426 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.44 
 
 
426 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.43 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  30.17 
 
 
401 aa  136  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.17 
 
 
401 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.08 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.66 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.68 
 
 
389 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  30.35 
 
 
470 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  30.35 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  30.35 
 
 
485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  30.08 
 
 
500 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  30.08 
 
 
483 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  30.08 
 
 
483 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  30.08 
 
 
483 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  30.08 
 
 
483 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 
411 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  31.06 
 
 
944 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.36 
 
 
392 aa  122  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  30.14 
 
 
389 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.86 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.05 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.89 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.83 
 
 
408 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.31 
 
 
392 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  27.49 
 
 
392 aa  56.6  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.73 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.97 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.28 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.98 
 
 
376 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.62 
 
 
403 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.78 
 
 
391 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.26 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.08 
 
 
396 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.45 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.09 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.12 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  26.18 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  22.57 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  26.43 
 
 
384 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  34.48 
 
 
389 aa  43.5  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>