128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0149 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  81.8 
 
 
483 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  81.8 
 
 
485 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  81.62 
 
 
426 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  81.09 
 
 
470 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  87.17 
 
 
427 aa  754    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  82.74 
 
 
426 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  82.49 
 
 
426 aa  683    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  81.8 
 
 
483 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  81.8 
 
 
483 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  81.8 
 
 
500 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  81.55 
 
 
489 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  81.8 
 
 
483 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  81.39 
 
 
426 aa  695    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  82.49 
 
 
426 aa  683    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  82.74 
 
 
426 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
420 aa  874    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  88.78 
 
 
427 aa  751    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  82.73 
 
 
343 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  64.39 
 
 
411 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  62.91 
 
 
412 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  58.56 
 
 
408 aa  487  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  59.64 
 
 
401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  59.14 
 
 
401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  58.12 
 
 
401 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  56.71 
 
 
394 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  55.01 
 
 
406 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  54.76 
 
 
401 aa  438  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  53.53 
 
 
944 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.44 
 
 
395 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  50.25 
 
 
391 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.34 
 
 
395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.16 
 
 
398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.44 
 
 
389 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  51.16 
 
 
389 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.77 
 
 
403 aa  306  3e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.46 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  37.88 
 
 
435 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.13 
 
 
418 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.8 
 
 
419 aa  192  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  33.86 
 
 
418 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.69 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.99 
 
 
414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.46 
 
 
418 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.65 
 
 
419 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.76 
 
 
419 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  36.34 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.08 
 
 
413 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.86 
 
 
425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.08 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.82 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.82 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.82 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.82 
 
 
413 aa  147  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  30.33 
 
 
413 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.33 
 
 
413 aa  146  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  30.33 
 
 
413 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.33 
 
 
413 aa  146  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.99 
 
 
408 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.44 
 
 
410 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.82 
 
 
413 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  32.51 
 
 
411 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.66 
 
 
425 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.63 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.41 
 
 
416 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.37 
 
 
414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  33.43 
 
 
414 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.49 
 
 
418 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  32.01 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.24 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.97 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.15 
 
 
419 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.87 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  34.02 
 
 
416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.43 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.69 
 
 
391 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  30.95 
 
 
634 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.74 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.44 
 
 
424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.96 
 
 
427 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.39 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.26 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.85 
 
 
392 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.12 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.2 
 
 
416 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.82 
 
 
412 aa  86.3  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.25 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.81 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.39 
 
 
396 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.22 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.7 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.96 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.02 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.1 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.3 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.16 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  29.23 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.48 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.09 
 
 
403 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.66 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  29.19 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>