144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1975 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
392 aa  817    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.85 
 
 
396 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.45 
 
 
402 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.29 
 
 
397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.28 
 
 
412 aa  345  6e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.16 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.81 
 
 
416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.06 
 
 
434 aa  322  8e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.77 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.72 
 
 
402 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  39.11 
 
 
410 aa  260  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.95 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.01 
 
 
390 aa  248  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.47 
 
 
393 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.79 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.43 
 
 
423 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.37 
 
 
427 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.32 
 
 
391 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.44 
 
 
400 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  25.27 
 
 
435 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.27 
 
 
418 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.4 
 
 
392 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.61 
 
 
392 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.49 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.68 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.26 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.19 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  25.76 
 
 
392 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.96 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.33 
 
 
401 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.57 
 
 
394 aa  87  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.24 
 
 
398 aa  86.3  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  22.08 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.3 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.81 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.07 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.75 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  24.79 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.79 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.21 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.93 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.79 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.93 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.79 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  24.79 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.93 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.97 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  26.06 
 
 
634 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.08 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.93 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.9 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  25.27 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.9 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.48 
 
 
389 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  25.08 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.72 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.8 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.69 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  24 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.51 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.54 
 
 
425 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.59 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.67 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.03 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.12 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  21.41 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.81 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.8 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.41 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.73 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.02 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  22.65 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  22.75 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.39 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.76 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  21.84 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.84 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.42 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  25.68 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.64 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.75 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  24.89 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  23 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.49 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  24 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  24.42 
 
 
369 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.8 
 
 
416 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.56 
 
 
410 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.01 
 
 
369 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  24.08 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  22.63 
 
 
374 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  23.48 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.67 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.67 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  25.29 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  21.9 
 
 
485 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.72 
 
 
404 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  21.9 
 
 
489 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.84 
 
 
412 aa  59.7  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  20.69 
 
 
427 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>