124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6381 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 427 aa  892    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  70.24 
 
 		 423 aa  649    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.99 
 
 		 419 aa  213  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.65 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  32 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.29 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.6 
 
 		 416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.68 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.4 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.1 
 
 		 402 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.37 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.7 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.94 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.07 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.94 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  26.62 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.66 
 
 		 397 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.68 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  26.68 
 
 		 386 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.06 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.11 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.7 
 
 		 401 aa  96.7  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  24.68 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.42 
 
 		 401 aa  93.2  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  25 
 
 		 470 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  24.23 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.96 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.23 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.11 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.82 
 
 		 408 aa  87.8  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.06 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.71 
 
 		 426 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.97 
 
 		 426 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.3 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.67 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.45 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  22.89 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.71 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  25.38 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.45 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  25.38 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  25.38 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  25.38 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  25.38 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.48 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.52 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  25.13 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  25.13 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.67 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  22.82 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.94 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.73 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.65 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.72 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.06 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.85 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.84 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  23.79 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  23.41 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.08 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.14 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.08 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.28 
 
 		 417 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  23.53 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.21 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.08 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.94 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.65 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.48 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.39 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  25.85 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  22.16 
 
 		 944 aa  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.85 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.65 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  25.3 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  21.98 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  25.19 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.85 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  23.24 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.34 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.26 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.93 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.26 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.26 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.26 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  25.09 
 
 		 382 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  23.78 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  25.62 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  23.4 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  22.51 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.22 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  21.73 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.73 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  21.73 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.73 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.73 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.73 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  22.01 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.11 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>