105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2871 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 382 aa  781    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  53.12 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  45.63 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  45.24 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  35.2 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  34.86 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  33.95 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  34.13 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  31.03 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  33.16 
 
 		 392 aa  143  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.59 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.97 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  30 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.02 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.3 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.31 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.31 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  29.62 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.79 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.18 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.68 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  27.32 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.2 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  27.32 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.77 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  26.94 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.32 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.32 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.32 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.06 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  26.94 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.24 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.07 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.15 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.53 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.53 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.07 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.78 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  26.15 
 
 		 369 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.88 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  25.21 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.9 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.66 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.85 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.51 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.26 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.9 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.66 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.02 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.88 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.86 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.12 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  24.61 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.69 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.53 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  24 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  28.76 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.14 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  29.31 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.99 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.58 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.85 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.33 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.88 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.87 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  24.87 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  25.94 
 
 		 470 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.53 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.14 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  23.34 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  29.79 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.04 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.34 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.21 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.07 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.09 
 
 		 427 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.56 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.81 
 
 		 392 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.05 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.53 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.57 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.52 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.54 
 
 		 397 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  26.34 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  26.34 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  26.34 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  25.52 
 
 		 500 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  26.34 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  25.52 
 
 		 485 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  25.52 
 
 		 489 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.91 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.89 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.66 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.68 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.98 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.51 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.48 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.63 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.19 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>