76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1847 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 401 aa  806    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  39.2 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  37.37 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  33.6 
 
 		 385 aa  200  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  37.63 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  33.88 
 
 		 376 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  34.93 
 
 		 392 aa  176  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  34.13 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  36.13 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.07 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.69 
 
 		 383 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  33.5 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.42 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  33.42 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  33.42 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  32.31 
 
 		 344 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  32.99 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  30.23 
 
 		 369 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  33.33 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.15 
 
 		 369 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.23 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.23 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.42 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.08 
 
 		 375 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.99 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.9 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  31.55 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.16 
 
 		 377 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.77 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.25 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.83 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.39 
 
 		 369 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.72 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.7 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.23 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.44 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.25 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.71 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  30 
 
 		 438 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  31.27 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  25.36 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.85 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.97 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  26.57 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.22 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.07 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.82 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.91 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.59 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.31 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.17 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.07 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.04 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.54 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.82 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.33 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.11 
 
 		 418 aa  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.36 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  26.9 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.56 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.23 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.72 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.98 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.34 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.78 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  28.28 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.22 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.47 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.81 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.37 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.09 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.86 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>