137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5652 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  70.24 
 
 		 427 aa  649    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 423 aa  874    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.56 
 
 		 419 aa  237  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.7 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.68 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.93 
 
 		 412 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.31 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.46 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.1 
 
 		 403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.58 
 
 		 390 aa  159  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.43 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.78 
 
 		 402 aa  153  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.38 
 
 		 402 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.49 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  28.53 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.73 
 
 		 389 aa  137  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  26.92 
 
 		 410 aa  135  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.73 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.72 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.63 
 
 		 394 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.04 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.07 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.5 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  25.25 
 
 		 401 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.86 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.3 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.43 
 
 		 398 aa  97.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.41 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.7 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.08 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.51 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.82 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.82 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.36 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.91 
 
 		 392 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  24.07 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  24 
 
 		 470 aa  90.9  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  24.69 
 
 		 944 aa  90.9  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.09 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.43 
 
 		 392 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.94 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.26 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.86 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  23.7 
 
 		 429 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.76 
 
 		 427 aa  87  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  25.36 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  27.41 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.5 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.82 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.61 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  26.46 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  24.47 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  22.71 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  23.48 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  23.48 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  23.48 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.46 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  23.48 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  23.48 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.93 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.07 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.04 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  23.19 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.58 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  23.23 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.45 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.23 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.69 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.45 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.16 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  30 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  23 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.11 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.61 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.07 
 
 		 369 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.42 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  23.41 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  22.42 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  23.53 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  23.46 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  21.8 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  24.62 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.26 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  23.26 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  23.26 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.26 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.26 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.26 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  23 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.84 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.18 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.52 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.58 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  20.11 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.86 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.86 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  21.41 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.35 
 
 		 365 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  21.58 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>