More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4222 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0655  glucose-6-phosphate isomerase  71.73 
 
 		 521 aa  728    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0621546  decreased coverage  0.00285419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 944 aa  1931    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0944  glucose-6-phosphate isomerase  68.85 
 
 		 532 aa  698    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0675  glucose-6-phosphate isomerase  65.1 
 
 		 538 aa  669    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1127  glucose-6-phosphate isomerase  72.47 
 
 		 522 aa  748    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0753  glucose-6-phosphate isomerase  73.8 
 
 		 525 aa  749    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1103  glucose-6-phosphate isomerase  70.46 
 
 		 520 aa  697    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0697  glucose-6-phosphate isomerase  65.79 
 
 		 538 aa  679    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000815409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5598  glucose-6-phosphate isomerase  71.84 
 
 		 520 aa  701    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.885182  normal  0.434558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3094  glucose-6-phosphate isomerase  61.41 
 
 		 545 aa  623  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5674  glucose-6-phosphate isomerase  60.22 
 
 		 540 aa  611  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3385  glucose-6-phosphate isomerase  60.55 
 
 		 545 aa  610  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  48.81 
 
 		 549 aa  496  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  50.56 
 
 		 541 aa  499  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  48.99 
 
 		 548 aa  492  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  48.55 
 
 		 548 aa  488  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  47.63 
 
 		 559 aa  487  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  50.29 
 
 		 562 aa  484  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 548 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  51.34 
 
 		 547 aa  480  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  47.9 
 
 		 548 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  48.79 
 
 		 546 aa  477  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  60.4 
 
 		 411 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  47.32 
 
 		 547 aa  479  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 		 543 aa  477  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  48.17 
 
 		 551 aa  475  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0378  glucose-6-phosphate isomerase  49.26 
 
 		 536 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  49.62 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  49.26 
 
 		 548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  49.43 
 
 		 541 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  51.35 
 
 		 543 aa  472  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 541 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 567 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  48.79 
 
 		 547 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  47.18 
 
 		 549 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 549 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  50.1 
 
 		 541 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  46.99 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  50.67 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  59.07 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  51.43 
 
 		 541 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 549 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  47.92 
 
 		 531 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  50.67 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  46.18 
 
 		 549 aa  467  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  48.87 
 
 		 560 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  46.84 
 
 		 552 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  46.69 
 
 		 552 aa  463  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  49.18 
 
 		 649 aa  465  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  50.48 
 
 		 541 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  46.27 
 
 		 549 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 549 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 545 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 549 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  46.36 
 
 		 548 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  49.08 
 
 		 615 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  55.47 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  46.36 
 
 		 548 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  46.36 
 
 		 548 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  55 
 
 		 426 aa  458  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 540 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 540 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 540 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 540 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  44.81 
 
 		 550 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 549 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 549 aa  459  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 540 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  46.85 
 
 		 549 aa  459  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  49.26 
 
 		 556 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 540 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  46.47 
 
 		 550 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 549 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  47.91 
 
 		 569 aa  459  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  46.18 
 
 		 549 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 549 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  55.64 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  47.33 
 
 		 545 aa  458  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  45.94 
 
 		 547 aa  459  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 549 aa  459  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 		 540 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  51.14 
 
 		 547 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  49.44 
 
 		 540 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  50.29 
 
 		 542 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  55.93 
 
 		 427 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  48.59 
 
 		 540 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  49.15 
 
 		 540 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  58.16 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 549 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16630  glucose-6-phosphate isomerase  46.21 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  55.39 
 
 		 426 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  49.44 
 
 		 556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  49.44 
 
 		 556 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  55.39 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>