119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2742 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
434 aa  892    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  53.25 
 
 
403 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.02 
 
 
397 aa  349  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.83 
 
 
396 aa  348  9e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.72 
 
 
412 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.77 
 
 
402 aa  333  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.71 
 
 
416 aa  325  8.000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.06 
 
 
392 aa  322  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.06 
 
 
403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.61 
 
 
390 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.3 
 
 
402 aa  300  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.31 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  38.72 
 
 
410 aa  249  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.14 
 
 
393 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.68 
 
 
423 aa  200  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  32 
 
 
427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.19 
 
 
419 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.35 
 
 
393 aa  99.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  25.06 
 
 
429 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.03 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.58 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.06 
 
 
391 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  26.89 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.98 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  24.38 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.19 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  23.56 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.53 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.96 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.36 
 
 
400 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.88 
 
 
401 aa  77  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.54 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.57 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.09 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.15 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.52 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.66 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  24.82 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  24.55 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.63 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  24.38 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  24.38 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  24.38 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  24.38 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  24.38 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.26 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.4 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.4 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.4 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.18 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.16 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.82 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  24.38 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  24.38 
 
 
485 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  24.09 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  23.87 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.82 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  24.88 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.08 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.04 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.3 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.87 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.32 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.86 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.13 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  24.39 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.75 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  24.39 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.38 
 
 
419 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.85 
 
 
367 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  25.51 
 
 
382 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.12 
 
 
398 aa  63.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.77 
 
 
366 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.71 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.3 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  31.08 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.88 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.42 
 
 
369 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  25.06 
 
 
399 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.19 
 
 
395 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.19 
 
 
395 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  23.18 
 
 
385 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.05 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.47 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.48 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  22.15 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  24.25 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  25.69 
 
 
435 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  24.29 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.61 
 
 
365 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.71 
 
 
418 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.09 
 
 
369 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  24.09 
 
 
344 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.83 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.86 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  25 
 
 
389 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.73 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.18 
 
 
414 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1928  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  22.55 
 
 
660 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1904  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  22.55 
 
 
660 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>