69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1947 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
393 aa  825    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  53.95 
 
 
403 aa  441  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.08 
 
 
393 aa  323  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.08 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.85 
 
 
401 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.46 
 
 
392 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.6 
 
 
400 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.22 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.25 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 
391 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.65 
 
 
402 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 
419 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.09 
 
 
416 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.96 
 
 
392 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5917  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  23.06 
 
 
415 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.87 
 
 
412 aa  94  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.7 
 
 
403 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3354  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.7 
 
 
419 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.8 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.63 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.42 
 
 
402 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.98 
 
 
434 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.47 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.4 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.37 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.72 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  25.57 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.91 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.54 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.29 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.41 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  22.94 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  24.74 
 
 
470 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  25.26 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  23.19 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  25.26 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  25.26 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  25.26 
 
 
489 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  25.26 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  25.26 
 
 
485 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  25.26 
 
 
500 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.95 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.67 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.67 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.92 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.67 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.02 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.41 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.41 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  21.64 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.58 
 
 
423 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.45 
 
 
393 aa  63.5  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.55 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.39 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.22 
 
 
427 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  24.92 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.15 
 
 
394 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  20.5 
 
 
410 aa  56.6  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.38 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.4 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  23 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.97 
 
 
392 aa  53.1  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  22.25 
 
 
944 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.15 
 
 
418 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.11 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.18 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  23.32 
 
 
382 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  23.47 
 
 
435 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.44 
 
 
411 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>