58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0508 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  853    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.43 
 
 		 412 aa  315  9e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.64 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.45 
 
 		 403 aa  299  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.31 
 
 		 403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.66 
 
 		 396 aa  283  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.2 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.03 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.11 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.6 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.72 
 
 		 434 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.49 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.53 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.32 
 
 		 393 aa  213  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.21 
 
 		 419 aa  183  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.62 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.92 
 
 		 423 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  23.89 
 
 		 429 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  23.78 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.38 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.43 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.14 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  23.26 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.32 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  25.56 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.95 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  22.58 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.34 
 
 		 389 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.87 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.45 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.6 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.6 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.93 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.89 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  27.21 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.99 
 
 		 376 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.93 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.93 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.31 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.8 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.43 
 
 		 369 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.26 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.77 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.5 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.62 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.65 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  22.92 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  22.76 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.34 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.94 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  21.04 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  22.34 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  22.81 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000253  hypothetical protein  31.43 
 
 		 481 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  20.37 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.17 
 
 		 369 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.65 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.65 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>