109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0603 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  88.61 
 
 		 404 aa  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 404 aa  829    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  69.31 
 
 		 377 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  67.42 
 
 		 365 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  64.29 
 
 		 377 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.74 
 
 		 376 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.19 
 
 		 366 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.49 
 
 		 377 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.54 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  51.93 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.25 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.83 
 
 		 395 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.83 
 
 		 395 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.55 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.47 
 
 		 375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.86 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.86 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.86 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  49.86 
 
 		 367 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  49.86 
 
 		 367 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.86 
 
 		 367 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.71 
 
 		 394 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  49.58 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  48.69 
 
 		 399 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  52.08 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  50 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.31 
 
 		 369 aa  315  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  50 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  46.93 
 
 		 408 aa  312  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.81 
 
 		 413 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.9 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  42.13 
 
 		 410 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  29.19 
 
 		 376 aa  119  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  29.38 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.43 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  27.57 
 
 		 392 aa  110  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  25.86 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  27.12 
 
 		 374 aa  100  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.26 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.58 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  25.13 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.83 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  31.56 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.91 
 
 		 425 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.27 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.99 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.22 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  34.59 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  25.06 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.6 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.76 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  26.77 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  27.27 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.24 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.43 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.68 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.07 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  31.71 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.49 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.71 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  37.3 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.39 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.34 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.35 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.84 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.01 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.86 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.84 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  31.33 
 
 		 634 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.97 
 
 		 403 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.85 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.05 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.79 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.6 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.19 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  25.08 
 
 		 418 aa  53.5  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  26.07 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.97 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.18 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.33 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.33 
 
 		 426 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  29.17 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.44 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  25.62 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.93 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.37 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.79 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.98 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.06 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 		 426 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  24.65 
 
 		 944 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.99 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.14 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.14 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.91 
 
 		 427 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  29.76 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.45 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.11 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.69 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>