105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3713 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  100 
 
 		 344 aa  705    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  82.85 
 
 		 377 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  71.39 
 
 		 369 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  71.69 
 
 		 369 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  69.28 
 
 		 365 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  62.57 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  62.57 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  62.57 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  62.87 
 
 		 367 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  62.57 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  62.57 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.88 
 
 		 369 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  62.28 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  61.61 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.58 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.58 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.58 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  61.98 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  61.66 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  61.35 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  54.79 
 
 		 408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  53.64 
 
 		 375 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.08 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  50.6 
 
 		 404 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.15 
 
 		 376 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.11 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.96 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.96 
 
 		 366 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.66 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.8 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.94 
 
 		 438 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  42.74 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  32.31 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.31 
 
 		 382 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  31.76 
 
 		 392 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  28.11 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  28.14 
 
 		 386 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  30.72 
 
 		 384 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  25.83 
 
 		 374 aa  86.3  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  29.62 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  27.09 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  28.01 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.64 
 
 		 408 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.89 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.39 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.49 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.94 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.04 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.25 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.64 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.98 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.81 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.84 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  27 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.66 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.38 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.63 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.36 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.94 
 
 		 390 aa  57  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.92 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.09 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.58 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.87 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.63 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.63 
 
 		 426 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.63 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.04 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.08 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  27.6 
 
 		 418 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  31.69 
 
 		 407 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.21 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.11 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.09 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  26.86 
 
 		 401 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.51 
 
 		 425 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.09 
 
 		 401 aa  52.8  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.58 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.18 
 
 		 426 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.06 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.82 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.25 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.45 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.31 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.78 
 
 		 418 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  26.56 
 
 		 944 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.56 
 
 		 403 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.58 
 
 		 423 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  29.24 
 
 		 427 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  31.01 
 
 		 435 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.12 
 
 		 401 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.01 
 
 		 427 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.76 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.71 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.5 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.48 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.21 
 
 		 418 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  28.17 
 
 		 470 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.39 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.07 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>