139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4956 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
396 aa  810    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.34 
 
 
403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.74 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.85 
 
 
392 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.82 
 
 
402 aa  364  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  43 
 
 
403 aa  348  8e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.83 
 
 
434 aa  348  8e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.86 
 
 
412 aa  339  5e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.8 
 
 
402 aa  323  5e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.18 
 
 
416 aa  322  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.21 
 
 
390 aa  297  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  37.66 
 
 
410 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.32 
 
 
389 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.44 
 
 
393 aa  227  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.4 
 
 
419 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.46 
 
 
423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.68 
 
 
427 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.62 
 
 
392 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.13 
 
 
395 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  25.43 
 
 
391 aa  96.7  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  20.89 
 
 
429 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.87 
 
 
403 aa  93.2  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.81 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.48 
 
 
392 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.4 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.39 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.82 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.44 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  20.79 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.6 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.63 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.42 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.8 
 
 
406 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.84 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.91 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.39 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.22 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.15 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.45 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.49 
 
 
412 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.9 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  27.2 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.83 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.1 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.12 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  21.8 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  21.39 
 
 
427 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  19.85 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.15 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.15 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.8 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.75 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.11 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.86 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.26 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.49 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.07 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.56 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.15 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.15 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.1 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.78 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.51 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  20.54 
 
 
483 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  20.54 
 
 
483 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  21.64 
 
 
944 aa  66.6  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  20.54 
 
 
483 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  20.54 
 
 
483 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  20.54 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  22.68 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  20.54 
 
 
485 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  20.54 
 
 
489 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.11 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.54 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2861  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  25.21 
 
 
620 aa  63.5  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  24.05 
 
 
404 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.49 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  22.49 
 
 
376 aa  62.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.98 
 
 
343 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.22 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4714  hypothetical protein  23.61 
 
 
732 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.823146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  21.15 
 
 
392 aa  59.7  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  23.58 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5018  hypothetical protein  23.67 
 
 
606 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  18.58 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.12 
 
 
418 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  24 
 
 
382 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.39 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.38 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.42 
 
 
404 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  21.17 
 
 
399 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  20.48 
 
 
374 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.41 
 
 
369 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.63 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.63 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  21.4 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.88 
 
 
367 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  21.4 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  25.21 
 
 
344 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.4 
 
 
400 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>