16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4714 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0816  hypothetical protein  51.56 
 
 		 719 aa  747    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0362395  hitchhiker  0.000117327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5018  hypothetical protein  63.04 
 
 		 606 aa  818    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4714  hypothetical protein  100 
 
 		 732 aa  1514    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.823146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2861  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  56.46 
 
 		 620 aa  728    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1904  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  41.01 
 
 		 660 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1928  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  41.01 
 
 		 660 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0358  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  39.35 
 
 		 668 aa  353  5.9999999999999994e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0710047  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.08 
 
 		 416 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5878  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  26.29 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000504158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.61 
 
 		 396 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.56 
 
 		 412 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.87 
 
 		 403 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.16 
 
 		 434 aa  51.2  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.95 
 
 		 403 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.19 
 
 		 393 aa  45.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.1 
 
 		 419 aa  44.3  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>