120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5399 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 403 aa  833    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.34 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.74 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.29 
 
 		 412 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.96 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.8 
 
 		 402 aa  332  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.16 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.21 
 
 		 403 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.06 
 
 		 434 aa  306  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  40.45 
 
 		 410 aa  299  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.85 
 
 		 416 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.95 
 
 		 389 aa  259  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.13 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.86 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.16 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.1 
 
 		 423 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.4 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.7 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  23.6 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.34 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.62 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.82 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.19 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.57 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  24.1 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.38 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  24.22 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.65 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.5 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.75 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.15 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.56 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.34 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.56 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.35 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.16 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.23 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.64 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.38 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.18 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  22.72 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.52 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.09 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  21.05 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.83 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.5 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.81 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.43 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.78 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.02 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.17 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.51 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  25.67 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  21.65 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  26.32 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.92 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.36 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  24.38 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  22.67 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.97 
 
 		 404 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.6 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.08 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.8 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.93 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.65 
 
 		 426 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  20.88 
 
 		 470 aa  53.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  23.87 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  23.9 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.9 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  23.9 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4714  hypothetical protein  22.87 
 
 		 732 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.823146 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.91 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.9 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.9 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.9 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.29 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.89 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  23.63 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.89 
 
 		 426 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  21.07 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  24.54 
 
 		 403 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  21.81 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  42.86 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  22.71 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.81 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.17 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  20.88 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.79 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.88 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.82 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  19.88 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.88 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.17 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.71 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  19.88 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.88 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.91 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.22 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  25.31 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.88 
 
 		 413 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>