107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4860 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 377 aa  775    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  97.27 
 
 		 366 aa  734    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  93.09 
 
 		 376 aa  726    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  85.75 
 
 		 365 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  69.78 
 
 		 377 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  66.86 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  64.29 
 
 		 404 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.1 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  48.15 
 
 		 399 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.17 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  48.14 
 
 		 403 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.61 
 
 		 400 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.61 
 
 		 400 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.61 
 
 		 400 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.61 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.61 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.23 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  47.96 
 
 		 367 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  47.96 
 
 		 367 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.37 
 
 		 369 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.9 
 
 		 394 aa  315  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.34 
 
 		 369 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.5 
 
 		 369 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.06 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.99 
 
 		 365 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.8 
 
 		 375 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  45.79 
 
 		 408 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  46.47 
 
 		 369 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  48.96 
 
 		 344 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.41 
 
 		 413 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.27 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  41.62 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  30.56 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  27.25 
 
 		 401 aa  99.4  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.79 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  24.73 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  26.93 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  25.2 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.03 
 
 		 383 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.9 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  29.14 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  28.87 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.25 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.65 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  25.61 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.79 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.93 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.07 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.39 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.56 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.92 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.36 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.58 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.89 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  30.77 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.33 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  31.08 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.17 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  24.73 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.88 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.54 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.16 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.03 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  25.33 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.72 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.03 
 
 		 419 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.34 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  29.19 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.75 
 
 		 397 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  27.98 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.34 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.96 
 
 		 412 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.05 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.38 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.77 
 
 		 401 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.6 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.95 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.09 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  25.5 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.31 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.27 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  23.31 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.22 
 
 		 416 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  32.33 
 
 		 634 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  26.74 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.32 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.8 
 
 		 427 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.32 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.42 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.64 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.42 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.59 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.79 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.79 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.79 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.62 
 
 		 406 aa  46.2  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.08 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.08 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.08 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.08 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.78432 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>