119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0158 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
369 aa  734    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  93.22 
 
 
395 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  93.22 
 
 
395 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  92.95 
 
 
369 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  89.39 
 
 
394 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  89.97 
 
 
394 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  89.39 
 
 
369 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  74.46 
 
 
367 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  74.8 
 
 
399 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  74.46 
 
 
400 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  74.46 
 
 
400 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  75 
 
 
367 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  74.46 
 
 
367 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  74.46 
 
 
400 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  74.18 
 
 
403 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.81 
 
 
369 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  61.89 
 
 
377 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  63.26 
 
 
369 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  61.48 
 
 
365 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  61.98 
 
 
344 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  55.77 
 
 
408 aa  355  5.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.91 
 
 
375 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.31 
 
 
404 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  48.88 
 
 
404 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.88 
 
 
365 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.88 
 
 
377 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.22 
 
 
377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.88 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.53 
 
 
376 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.55 
 
 
413 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.16 
 
 
438 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  45.58 
 
 
410 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  31.58 
 
 
392 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  31.83 
 
 
401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  29.78 
 
 
374 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  26.39 
 
 
385 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  29.4 
 
 
376 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  28.13 
 
 
386 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  29.56 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  29.31 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.78 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.61 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  26.85 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.42 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  28.21 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  35.85 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.92 
 
 
419 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.41 
 
 
392 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.13 
 
 
403 aa  62.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.11 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.97 
 
 
425 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.03 
 
 
410 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.63 
 
 
395 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.83 
 
 
418 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  35.56 
 
 
435 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.1 
 
 
392 aa  56.2  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.82 
 
 
406 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.22 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.79 
 
 
408 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.33 
 
 
393 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.22 
 
 
426 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.38 
 
 
414 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  35 
 
 
418 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.78 
 
 
416 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  26.99 
 
 
470 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.91 
 
 
426 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.91 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.18 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.61 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.57 
 
 
398 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.91 
 
 
426 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.97 
 
 
401 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  18.77 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  27.42 
 
 
427 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.29 
 
 
419 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.4 
 
 
343 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.38 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.26 
 
 
401 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.31 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.55 
 
 
427 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  24.72 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.57 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.73 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  34.68 
 
 
634 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.76 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.84 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.42 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  36.59 
 
 
415 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  25.43 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.06 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.3 
 
 
426 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.31 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.17 
 
 
412 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.07 
 
 
403 aa  46.2  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.09 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  24.82 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.17 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 
401 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  26.7 
 
 
413 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.82 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>