109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4653 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  85.75 
 
 		 377 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  85.21 
 
 		 366 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  86.58 
 
 		 376 aa  657    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 365 aa  749    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  68.44 
 
 		 377 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  68.29 
 
 		 404 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  67.42 
 
 		 404 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  48.23 
 
 		 367 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  48.23 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.23 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.23 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.23 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  48.23 
 
 		 367 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.23 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  48.5 
 
 		 399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.55 
 
 		 377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.24 
 
 		 369 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.7 
 
 		 395 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.7 
 
 		 395 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.79 
 
 		 394 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.54 
 
 		 369 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.51 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.88 
 
 		 369 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.61 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  46.2 
 
 		 369 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.17 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.28 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  48.66 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  44.62 
 
 		 408 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.04 
 
 		 413 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.58 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  41.58 
 
 		 410 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  28.29 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  28.23 
 
 		 401 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  28.34 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.18 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  23.73 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  24.93 
 
 		 374 aa  92.8  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.06 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.41 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.53 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.8 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  31.91 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.93 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  28.87 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.73 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.32 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.87 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.19 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.96 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.56 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.93 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.9 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  26.47 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.56 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  26.17 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  30.68 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.58 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.81 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  29.76 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.01 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  25.99 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.75 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.03 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.36 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  29.41 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.17 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.54 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  24.87 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.48 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.09 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.43 
 
 		 416 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.34 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  32.54 
 
 		 634 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.86 
 
 		 417 aa  50.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  26.35 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.73 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.68 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.37 
 
 		 419 aa  50.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.54 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  26.79 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  25.74 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.68 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.57 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.1 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.59 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.76 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  25.42 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.69 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.81 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.22 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.83 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.8 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.37 
 
 		 419 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.88 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.81 
 
 		 424 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.71 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.71 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.71 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.68 
 
 		 418 aa  43.5  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0295295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>