118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0388 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
424 aa  849    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.44 
 
 
416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  54.33 
 
 
634 aa  404  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  56.97 
 
 
410 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  45.08 
 
 
413 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.08 
 
 
413 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  45.08 
 
 
413 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.08 
 
 
413 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.22 
 
 
413 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.56 
 
 
413 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.56 
 
 
413 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.56 
 
 
413 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.56 
 
 
413 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.04 
 
 
413 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.8 
 
 
413 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.13 
 
 
425 aa  355  6.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.77 
 
 
417 aa  354  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  50.88 
 
 
407 aa  352  8e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.53 
 
 
425 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  46.27 
 
 
411 aa  350  2e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  48.8 
 
 
415 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  49.28 
 
 
414 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.79 
 
 
414 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.69 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.39 
 
 
419 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  48.31 
 
 
416 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.45 
 
 
408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.78 
 
 
404 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.65 
 
 
418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.85 
 
 
417 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.02 
 
 
391 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.44 
 
 
417 aa  286  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.6 
 
 
417 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  38.07 
 
 
435 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.07 
 
 
418 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  36.1 
 
 
418 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.26 
 
 
419 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.55 
 
 
418 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.14 
 
 
414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.43 
 
 
419 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.67 
 
 
403 aa  186  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.25 
 
 
392 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.16 
 
 
408 aa  146  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.11 
 
 
419 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.32 
 
 
398 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.39 
 
 
406 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.18 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.9 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.72 
 
 
408 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  29.95 
 
 
427 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.95 
 
 
427 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.73 
 
 
395 aa  136  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.75 
 
 
401 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  32.17 
 
 
401 aa  133  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.44 
 
 
420 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.27 
 
 
426 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.57 
 
 
426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.57 
 
 
426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.57 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.57 
 
 
426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.47 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  28.99 
 
 
391 aa  127  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.71 
 
 
389 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  29.32 
 
 
470 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.61 
 
 
426 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.54 
 
 
395 aa  124  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  31.05 
 
 
944 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.16 
 
 
394 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.91 
 
 
343 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  28.32 
 
 
483 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  28.32 
 
 
483 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  28.32 
 
 
483 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  28.32 
 
 
483 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.22 
 
 
411 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  28.32 
 
 
489 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  28.32 
 
 
485 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  28.32 
 
 
500 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  27.46 
 
 
389 aa  104  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.8 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.94 
 
 
438 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.07 
 
 
393 aa  56.6  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  30.11 
 
 
408 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  30.48 
 
 
392 aa  53.9  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.17 
 
 
365 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  27.47 
 
 
404 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.17 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.25 
 
 
375 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  28.65 
 
 
344 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.78 
 
 
389 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.65 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.65 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  26.69 
 
 
386 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.68 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  28.4 
 
 
410 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.25 
 
 
366 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.48 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.14 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  28.57 
 
 
369 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.95 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  25 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>