145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4916 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 386 aa  781    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  39.2 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  35.54 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  34.82 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  33.24 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  32.7 
 
 		 374 aa  186  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  37 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  34.86 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  33.15 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  35.16 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  30.08 
 
 		 390 aa  156  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.96 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.53 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.65 
 
 		 375 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.68 
 
 		 427 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  31.89 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.66 
 
 		 419 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  31.23 
 
 		 367 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.23 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.23 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  31.23 
 
 		 367 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.23 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.71 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.14 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.26 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.26 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  30 
 
 		 369 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  29.92 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  29.66 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  30.33 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.4 
 
 		 394 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  28.14 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.5 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.73 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.32 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.76 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.85 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.57 
 
 		 365 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.2 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.53 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.13 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.76 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.3 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.05 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.69 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.08 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.56 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.43 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.98 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.73 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.55 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.8 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  24.52 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  29.05 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.61 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.4 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.61 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.92 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.61 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.87 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.39 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.05 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  27.31 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.75 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  26.2 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.94 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  26 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.69 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  27.3 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.31 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.11 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.94 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  28.25 
 
 		 944 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.31 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.47 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.15 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.86 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.04 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.79 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  23.26 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.23 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.15 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.57 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.85 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.85 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.51 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  24.77 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.36 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.85 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.85 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.62 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.88 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.98 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.53 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.24 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  23.72 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.72 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  23.72 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.72 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.72 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>