110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4917 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  93.09 
 
 		 377 aa  726    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  91.78 
 
 		 366 aa  696    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 376 aa  774    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  86.58 
 
 		 365 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  68.96 
 
 		 377 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  66.29 
 
 		 404 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.74 
 
 		 404 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.83 
 
 		 377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  47.09 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.43 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  47.07 
 
 		 403 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.07 
 
 		 400 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.07 
 
 		 400 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.07 
 
 		 400 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.5 
 
 		 395 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.5 
 
 		 395 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  47.41 
 
 		 367 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.41 
 
 		 367 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  47.41 
 
 		 367 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.37 
 
 		 369 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  46.6 
 
 		 408 aa  312  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.24 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.69 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  46.88 
 
 		 369 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.45 
 
 		 375 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.38 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.53 
 
 		 369 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  50.15 
 
 		 344 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.83 
 
 		 394 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.15 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.16 
 
 		 438 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  40.76 
 
 		 410 aa  215  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  29.33 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  27.7 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.07 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  25.54 
 
 		 374 aa  99.4  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  27.13 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  24.87 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.38 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  29.49 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.82 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.9 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  28.5 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.65 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.63 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.63 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.05 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.86 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.31 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  25.39 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.82 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.34 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.64 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.34 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  31.25 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.37 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  31.29 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.71 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.58 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  24.28 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.16 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.03 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.72 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.76 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.03 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.34 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  28.92 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.64 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.75 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.14 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.04 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  22.69 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  28.27 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.23 
 
 		 417 aa  53.9  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.52 
 
 		 416 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.31 
 
 		 418 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.09 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.31 
 
 		 392 aa  53.9  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.73 
 
 		 418 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  25.07 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.77 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  22.99 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.27 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  32.28 
 
 		 634 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.47 
 
 		 424 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  27.01 
 
 		 416 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.11 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  26.85 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.15 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.22 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.67 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.22 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.26 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.23 
 
 		 406 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.91 
 
 		 408 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.37 
 
 		 427 aa  46.2  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.16 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.36 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.7 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.53 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>