134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2912 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  90.45 
 
 
414 aa  794    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
419 aa  862    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  86.87 
 
 
419 aa  744    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  70.66 
 
 
418 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  52.59 
 
 
435 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.35 
 
 
418 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.24 
 
 
418 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.92 
 
 
414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  40.68 
 
 
414 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.32 
 
 
413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.03 
 
 
425 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.84 
 
 
413 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.84 
 
 
413 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.84 
 
 
413 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.84 
 
 
413 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.08 
 
 
413 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  35.84 
 
 
413 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.84 
 
 
413 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.84 
 
 
413 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.99 
 
 
425 aa  247  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  35.84 
 
 
413 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.08 
 
 
413 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  40 
 
 
407 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  37.71 
 
 
415 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  37.9 
 
 
634 aa  237  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  39.23 
 
 
416 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.83 
 
 
410 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.37 
 
 
419 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.32 
 
 
427 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.87 
 
 
408 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.29 
 
 
416 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.84 
 
 
403 aa  218  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.12 
 
 
417 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.2 
 
 
417 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.52 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.56 
 
 
424 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.87 
 
 
417 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.1 
 
 
417 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  34.24 
 
 
411 aa  202  8e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.64 
 
 
404 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.56 
 
 
395 aa  193  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  30.23 
 
 
391 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.9 
 
 
398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.82 
 
 
389 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.67 
 
 
391 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.35 
 
 
394 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.88 
 
 
408 aa  180  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.11 
 
 
401 aa  179  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.23 
 
 
406 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 
427 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  31.84 
 
 
401 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.82 
 
 
426 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.97 
 
 
401 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.82 
 
 
426 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.08 
 
 
427 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.56 
 
 
426 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.56 
 
 
426 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.65 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.82 
 
 
426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.82 
 
 
426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.21 
 
 
401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.75 
 
 
392 aa  172  9e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.53 
 
 
395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.14 
 
 
412 aa  166  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  32.56 
 
 
470 aa  166  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.66 
 
 
343 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  31.5 
 
 
389 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.74 
 
 
500 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  32.74 
 
 
483 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.74 
 
 
483 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  32.74 
 
 
483 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.74 
 
 
483 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.8 
 
 
411 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.48 
 
 
489 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  32.48 
 
 
485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  33.51 
 
 
944 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.6 
 
 
408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 
419 aa  137  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.97 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  26.87 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.62 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.47 
 
 
423 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.81 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.55 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.22 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  28.24 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.65 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  26.89 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.92 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.16 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  25 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.51 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.14 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  29.69 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.38 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.44 
 
 
402 aa  67  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.62 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  26.39 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  29.28 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 
404 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>