129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0118 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 395 aa  827    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  70.38 
 
 		 395 aa  597  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  67.35 
 
 		 391 aa  575  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  66.32 
 
 		 389 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  64.78 
 
 		 389 aa  519  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.91 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  54.64 
 
 		 401 aa  425  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  54.38 
 
 		 401 aa  424  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  55.15 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.12 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  51.93 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  53.73 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.64 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.88 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.34 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.67 
 
 		 427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.38 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.63 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  50.25 
 
 		 470 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.76 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.63 
 
 		 426 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.51 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  51.01 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  51.01 
 
 		 489 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  50.51 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  50.51 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  50.51 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  50.51 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  50.51 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.74 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.75 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.96 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  54.43 
 
 		 343 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 944 aa  339  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.03 
 
 		 392 aa  285  7e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.33 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.17 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.14 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.09 
 
 		 414 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.12 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  32.05 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  30.99 
 
 		 418 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.53 
 
 		 419 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.95 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.62 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.16 
 
 		 417 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  32.57 
 
 		 407 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.58 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  34.11 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.09 
 
 		 425 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.84 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.58 
 
 		 413 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.59 
 
 		 416 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  27.32 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.32 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  27.32 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.32 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.09 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.58 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.58 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.84 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.58 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  33.8 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  29.57 
 
 		 634 aa  126  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.58 
 
 		 410 aa  126  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.99 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.58 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  32.46 
 
 		 416 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.05 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.43 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.95 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  32.96 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.63 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.12 
 
 		 427 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.05 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.9 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.97 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.13 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.21 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.94 
 
 		 423 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.65 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.73 
 
 		 419 aa  79.3  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.11 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.72 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.87 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.59 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.54 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  28.22 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  26.84 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.57 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.22 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.06 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.13 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.05 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.24 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.66 
 
 		 402 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.83 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.65 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  26.23 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.33 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>