108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4409 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  92.01 
 
 		 413 aa  809    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  92.01 
 
 		 413 aa  809    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  92.01 
 
 		 413 aa  809    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  92.01 
 
 		 413 aa  808    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  95.16 
 
 		 413 aa  827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  95.16 
 
 		 413 aa  827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  99.27 
 
 		 413 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  95.16 
 
 		 413 aa  827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 413 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  92.49 
 
 		 413 aa  811    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  92.01 
 
 		 413 aa  809    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  60.88 
 
 		 416 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.24 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  45.83 
 
 		 634 aa  355  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.05 
 
 		 425 aa  349  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.4 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.53 
 
 		 408 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.98 
 
 		 427 aa  343  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  46.09 
 
 		 407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.55 
 
 		 414 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.61 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.56 
 
 		 424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  44.55 
 
 		 414 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.39 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  42.68 
 
 		 415 aa  325  8.000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.92 
 
 		 417 aa  319  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  43.6 
 
 		 416 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.13 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.5 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  39.55 
 
 		 411 aa  302  7.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.2 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.25 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.39 
 
 		 418 aa  273  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  36.56 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  36.59 
 
 		 435 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.32 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.78 
 
 		 414 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.34 
 
 		 418 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.16 
 
 		 418 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.21 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.92 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.65 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.61 
 
 		 401 aa  166  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  31.48 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.48 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.33 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.27 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.93 
 
 		 408 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.64 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.41 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.93 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  30.08 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.61 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.08 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.01 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.01 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  29.72 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.2 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.75 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.46 
 
 		 426 aa  146  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  29 
 
 		 426 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.28 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.86 
 
 		 419 aa  142  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  27.44 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.61 
 
 		 389 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.24 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.05 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  28.03 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  28.03 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  28.03 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  28.03 
 
 		 500 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  28.03 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.44 
 
 		 343 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.09 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  28.84 
 
 		 944 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  27.78 
 
 		 485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  27.78 
 
 		 489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  27.81 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.93 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.5 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.12 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.08 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  24.82 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.26 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.15 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  23.16 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.48 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.38 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.55 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.86 
 
 		 369 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.21 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  25 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.42 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.46 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  28.38 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.57 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.57 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.57 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.2 
 
 		 438 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.79 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>