104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0199 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  100 
 
 
411 aa  840    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  53.32 
 
 
417 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  50.73 
 
 
415 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.66 
 
 
410 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  47.91 
 
 
634 aa  335  7e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.27 
 
 
424 aa  315  6e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.28 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.67 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.21 
 
 
413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.55 
 
 
413 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  39.3 
 
 
413 aa  302  9e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.3 
 
 
413 aa  302  9e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.3 
 
 
413 aa  302  9e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  39.3 
 
 
413 aa  302  9e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.67 
 
 
427 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.55 
 
 
413 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.55 
 
 
413 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.55 
 
 
413 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.3 
 
 
413 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.78 
 
 
418 aa  300  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.3 
 
 
413 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.16 
 
 
425 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.8 
 
 
404 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  44.13 
 
 
407 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.2 
 
 
414 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.05 
 
 
419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  40.9 
 
 
414 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.4 
 
 
417 aa  265  8.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.16 
 
 
408 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.82 
 
 
417 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  41.9 
 
 
416 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.7 
 
 
417 aa  240  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.54 
 
 
391 aa  239  9e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  36.27 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.27 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.91 
 
 
418 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  33.95 
 
 
418 aa  202  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.23 
 
 
419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.5 
 
 
414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.45 
 
 
403 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.74 
 
 
419 aa  182  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.32 
 
 
406 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.33 
 
 
392 aa  159  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  36.75 
 
 
401 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.73 
 
 
398 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  32.79 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.8 
 
 
401 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.71 
 
 
394 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.09 
 
 
401 aa  151  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.59 
 
 
408 aa  150  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  37.21 
 
 
470 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.62 
 
 
395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.88 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.7 
 
 
426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.06 
 
 
426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.91 
 
 
401 aa  146  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.51 
 
 
426 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.51 
 
 
420 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.69 
 
 
426 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  37.55 
 
 
944 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.69 
 
 
426 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.69 
 
 
343 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  35.02 
 
 
391 aa  139  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.94 
 
 
426 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.44 
 
 
412 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.11 
 
 
395 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 
419 aa  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  35.38 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  38.81 
 
 
485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  35.38 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  35.38 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  35.38 
 
 
500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  38.81 
 
 
489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  35.38 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.08 
 
 
389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.64 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  35.68 
 
 
389 aa  117  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.79 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.62 
 
 
423 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  30.52 
 
 
392 aa  60.5  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.67 
 
 
366 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.92 
 
 
376 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.19 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.41 
 
 
365 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  24.16 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.09 
 
 
419 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.78 
 
 
427 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.84 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  28.16 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.53 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.55 
 
 
369 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.21 
 
 
401 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.28 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  30.27 
 
 
369 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.44 
 
 
412 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.28 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.82 
 
 
382 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.87 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.21 
 
 
377 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.24 
 
 
392 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>