137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0348 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  96.54 
 
 
483 aa  838    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  97.75 
 
 
485 aa  845    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  84.06 
 
 
426 aa  732    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  86.5 
 
 
470 aa  804    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  81.82 
 
 
427 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  84.94 
 
 
426 aa  730    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  84.79 
 
 
426 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  96.54 
 
 
483 aa  838    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  96.54 
 
 
483 aa  838    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  95.8 
 
 
500 aa  831    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  100 
 
 
489 aa  992    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  96.54 
 
 
483 aa  838    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  84.13 
 
 
426 aa  740    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  85.18 
 
 
426 aa  722    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  85.19 
 
 
426 aa  730    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  81.23 
 
 
420 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  83.8 
 
 
427 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  85.76 
 
 
343 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  64.84 
 
 
411 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.68 
 
 
412 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  57.39 
 
 
408 aa  478  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  58.35 
 
 
401 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  57.39 
 
 
394 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  57.88 
 
 
401 aa  465  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  57.14 
 
 
401 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  58.13 
 
 
944 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  54.45 
 
 
406 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  53.81 
 
 
401 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.65 
 
 
395 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.01 
 
 
395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.64 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  49.36 
 
 
391 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.89 
 
 
389 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  50.51 
 
 
389 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.83 
 
 
403 aa  301  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.28 
 
 
392 aa  289  6e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  36.64 
 
 
435 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.9 
 
 
418 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  34.64 
 
 
418 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.74 
 
 
408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.05 
 
 
419 aa  183  7e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.82 
 
 
414 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.71 
 
 
418 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.4 
 
 
419 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.58 
 
 
425 aa  159  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.74 
 
 
419 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  37.11 
 
 
407 aa  158  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.65 
 
 
425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.56 
 
 
417 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.33 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  38.81 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  32.61 
 
 
414 aa  146  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.15 
 
 
418 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.9 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.54 
 
 
413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.56 
 
 
413 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  27.56 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.56 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  27.56 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.56 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.29 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.29 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.54 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.29 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.49 
 
 
417 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.56 
 
 
413 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.96 
 
 
408 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.91 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.82 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  36.5 
 
 
416 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  37.11 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.71 
 
 
419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.66 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.88 
 
 
427 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.33 
 
 
417 aa  124  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  32.19 
 
 
634 aa  119  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.69 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.82 
 
 
424 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.3 
 
 
416 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.06 
 
 
419 aa  90.5  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.38 
 
 
427 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.25 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.62 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.97 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.23 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.54 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.32 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.2 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.7 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.62 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.79 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.45 
 
 
389 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.17 
 
 
402 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.9 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  31.4 
 
 
408 aa  65.1  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.54 
 
 
390 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  29.32 
 
 
386 aa  61.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  26.17 
 
 
382 aa  60.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.33 
 
 
393 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.03 
 
 
392 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>