101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3002 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 402 aa  834    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.04 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.77 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.33 
 
 		 416 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.8 
 
 		 403 aa  340  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.47 
 
 		 397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.8 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.71 
 
 		 412 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.72 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.55 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.46 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  40.2 
 
 		 410 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.91 
 
 		 390 aa  272  9e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.77 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.64 
 
 		 419 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.78 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.94 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.15 
 
 		 393 aa  106  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.25 
 
 		 392 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.96 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.3 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.61 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.49 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.62 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  20.76 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.49 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.87 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.96 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  23.12 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  24.56 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.29 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.75 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  21.61 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.91 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.5 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.44 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.15 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  22.65 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.67 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.33 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.77 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.94 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  23.16 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  20.92 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.3 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.45 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.66 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.43 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.7 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.7 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.97 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  22.25 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.87 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.43 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.12 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  23.53 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  22.06 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.44 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.87 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.61 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  20.94 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  24.19 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  20.34 
 
 		 944 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  21.57 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  21.57 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  21.57 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  21.57 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  21.57 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  21.57 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  21.57 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.44 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  22.19 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  18.46 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.67 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.59 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.13 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  20.45 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  22.36 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.68 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  20.81 
 
 		 374 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  29.07 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.8 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.81 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.34 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.93 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.81 
 
 		 366 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.61 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.78432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  21.61 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.61 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.27 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.61 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  21.61 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.26 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.26 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.26 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  22.3 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.79 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2861  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  19.1 
 
 		 620 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  19.74 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.62 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>