38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4816 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  100 
 
 
429 aa  892    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.29 
 
 
419 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.06 
 
 
434 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.89 
 
 
396 aa  93.6  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  23.89 
 
 
410 aa  89.7  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.7 
 
 
423 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.7 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.89 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.12 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.6 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.42 
 
 
402 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.58 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  24 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.1 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.84 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.53 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.76 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.6 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.43 
 
 
389 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.58 
 
 
412 aa  57  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.87 
 
 
401 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.2 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.33 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.74 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.53 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.59 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  24.12 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.16 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.81 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.53 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.53 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.59 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.02 
 
 
395 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.71 
 
 
426 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.07 
 
 
400 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.53 
 
 
418 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  21.09 
 
 
435 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  22.98 
 
 
401 aa  43.1  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>