120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3983 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
397 aa  827    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.74 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.74 
 
 
403 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.58 
 
 
402 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.29 
 
 
392 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.79 
 
 
412 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.02 
 
 
434 aa  349  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.47 
 
 
402 aa  326  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.95 
 
 
403 aa  315  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  42.64 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.4 
 
 
416 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.05 
 
 
390 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.22 
 
 
389 aa  273  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.79 
 
 
393 aa  236  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.25 
 
 
419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.66 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.73 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.11 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.3 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.74 
 
 
417 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.8 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.97 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  24.56 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  24.03 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.59 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.39 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.04 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.97 
 
 
403 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.37 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.1 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  20.84 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.02 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.71 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.45 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  24.51 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.43 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.39 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.37 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.68 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.85 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  24.06 
 
 
389 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.66 
 
 
411 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.46 
 
 
426 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.47 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.21 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.47 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.47 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.53 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  22.66 
 
 
369 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.35 
 
 
404 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.46 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.53 
 
 
419 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.8 
 
 
425 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  22.34 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  21.39 
 
 
470 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.21 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.75 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.9 
 
 
427 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.75 
 
 
401 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  22.64 
 
 
404 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.58 
 
 
420 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  22.02 
 
 
427 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.91 
 
 
369 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.75 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.08 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.75 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.03 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.72 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.66 
 
 
413 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.66 
 
 
413 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.66 
 
 
413 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.46 
 
 
425 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.26 
 
 
366 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.53 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.38 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  24.44 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.44 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  24.9 
 
 
390 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  21.77 
 
 
435 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  24.44 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.44 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  21.77 
 
 
376 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.38 
 
 
413 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  22.69 
 
 
385 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  22.92 
 
 
944 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.5 
 
 
414 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.17 
 
 
413 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.5 
 
 
377 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  25.54 
 
 
382 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.31 
 
 
394 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.57 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  24 
 
 
416 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.54 
 
 
377 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.26 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  27.93 
 
 
489 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  27.93 
 
 
483 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  27.93 
 
 
485 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  27.93 
 
 
483 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  22.08 
 
 
500 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  27.93 
 
 
483 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>